Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZIC1Q15915 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZIC1Q15915 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ZIC1Q15915 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ZIC1Q15915 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
ZIC1Q15915 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ZIC1Q15915 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
ZIC1Q15915 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZIC1Q15915 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZIC1Q15915 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZIC1Q15915 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZIC1Q15915 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZIC1Q15915 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZIC1Q15915 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZIC1Q15915 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZIC1Q15915 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZIC1Q15915 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZIC1Q15915 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZIC1Q15915 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZIC1Q15915 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZIC1Q15915 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZIC1Q15915 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ZIC1Q15915 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZIC1Q15915 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ZIC1Q15915 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZIC1Q15915 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZIC1Q15915 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZIC1Q15915 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZIC1Q15915 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZIC1Q15915 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZIC1Q15915 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZIC1Q15915 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ZIC1Q15915 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZIC1Q15915 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZIC1Q15915 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZIC1Q15915 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZIC1Q15915 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZIC1Q15915 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZIC1Q15915 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZIC1Q15915 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZIC1Q15915 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZIC1Q15915 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZIC1Q15915 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZIC1Q15915 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZIC1Q15915 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZIC1Q15915 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZIC1Q15915 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZIC1Q15915 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZIC1Q15915 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZIC1Q15915 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZIC1Q15915 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZIC1Q15915 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZIC1Q15915 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZIC1Q15915 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZIC1Q15915 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZIC1Q15915 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZIC1Q15915 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZIC1Q15915 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZIC1Q15915 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZIC1Q15915 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZIC1Q15915 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZIC1Q15915 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZIC1Q15915 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZIC1Q15915 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZIC1Q15915 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZIC1Q15915 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZIC1Q15915 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZIC1Q15915 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZIC1Q15915 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZIC1Q15915 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ZIC1Q15915 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZIC1Q15915 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZIC1Q15915 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZIC1Q15915 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZIC1Q15915 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZIC1Q15915 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZIC1Q15915 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZIC1Q15915 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZIC1Q15915 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZIC1Q15915 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZIC1Q15915 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZIC1Q15915 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZIC1Q15915 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZIC1Q15915 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZIC1Q15915 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZIC1Q15915 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZIC1Q15915 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZIC1Q15915 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZIC1Q15915 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZIC1Q15915 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZIC1Q15915 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZIC1Q15915 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZIC1Q15915 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZIC1Q15915 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZIC1Q15915 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZIC1Q15915 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZIC1Q15915 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZIC1Q15915 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ZIC1Q15915 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZIC1Q15915 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
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