Protein–RNA interactions for Protein: Q15811

ITSN1, Intersectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,721 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITSN1Q15811 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ITSN1Q15811 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ITSN1Q15811 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ITSN1Q15811 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ITSN1Q15811 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ITSN1Q15811 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ITSN1Q15811 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ITSN1Q15811 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ITSN1Q15811 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ITSN1Q15811 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ITSN1Q15811 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ITSN1Q15811 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
ITSN1Q15811 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ITSN1Q15811 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ITSN1Q15811 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ITSN1Q15811 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ITSN1Q15811 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
ITSN1Q15811 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ITSN1Q15811 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ITSN1Q15811 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ITSN1Q15811 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ITSN1Q15811 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ITSN1Q15811 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ITSN1Q15811 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ITSN1Q15811 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ITSN1Q15811 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ITSN1Q15811 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ITSN1Q15811 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
ITSN1Q15811 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ITSN1Q15811 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ITSN1Q15811 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ITSN1Q15811 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ITSN1Q15811 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ITSN1Q15811 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ITSN1Q15811 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ITSN1Q15811 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ITSN1Q15811 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ITSN1Q15811 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ITSN1Q15811 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ITSN1Q15811 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ITSN1Q15811 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ITSN1Q15811 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ITSN1Q15811 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ITSN1Q15811 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ITSN1Q15811 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ITSN1Q15811 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ITSN1Q15811 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ITSN1Q15811 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ITSN1Q15811 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ITSN1Q15811 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ITSN1Q15811 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ITSN1Q15811 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ITSN1Q15811 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ITSN1Q15811 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ITSN1Q15811 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ITSN1Q15811 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ITSN1Q15811 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ITSN1Q15811 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ITSN1Q15811 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ITSN1Q15811 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ITSN1Q15811 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ITSN1Q15811 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ITSN1Q15811 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ITSN1Q15811 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
ITSN1Q15811 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
ITSN1Q15811 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ITSN1Q15811 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ITSN1Q15811 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ITSN1Q15811 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ITSN1Q15811 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ITSN1Q15811 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ITSN1Q15811 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ITSN1Q15811 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ITSN1Q15811 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ITSN1Q15811 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ITSN1Q15811 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ITSN1Q15811 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
ITSN1Q15811 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ITSN1Q15811 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
ITSN1Q15811 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ITSN1Q15811 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ITSN1Q15811 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ITSN1Q15811 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ITSN1Q15811 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ITSN1Q15811 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ITSN1Q15811 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
ITSN1Q15811 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ITSN1Q15811 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ITSN1Q15811 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ITSN1Q15811 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ITSN1Q15811 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ITSN1Q15811 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ITSN1Q15811 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ITSN1Q15811 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ITSN1Q15811 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ITSN1Q15811 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ITSN1Q15811 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ITSN1Q15811 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ITSN1Q15811 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ITSN1Q15811 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
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