Protein–RNA interactions for Protein: Q15154

PCM1, Pericentriolar material 1 protein, humanhuman

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Length 2,024 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCM1Q15154 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
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PCM1Q15154 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PCM1Q15154 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PCM1Q15154 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PCM1Q15154 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PCM1Q15154 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PCM1Q15154 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PCM1Q15154 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PCM1Q15154 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PCM1Q15154 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PCM1Q15154 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PCM1Q15154 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
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PCM1Q15154 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PCM1Q15154 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PCM1Q15154 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PCM1Q15154 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
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PCM1Q15154 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PCM1Q15154 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PCM1Q15154 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PCM1Q15154 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PCM1Q15154 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PCM1Q15154 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PCM1Q15154 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PCM1Q15154 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
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PCM1Q15154 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
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PCM1Q15154 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
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PCM1Q15154 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PCM1Q15154 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
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PCM1Q15154 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PCM1Q15154 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
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PCM1Q15154 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PCM1Q15154 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PCM1Q15154 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PCM1Q15154 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PCM1Q15154 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PCM1Q15154 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PCM1Q15154 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PCM1Q15154 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
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PCM1Q15154 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PCM1Q15154 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PCM1Q15154 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PCM1Q15154 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PCM1Q15154 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
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