Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHD4Q14839 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHD4Q14839 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHD4Q14839 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CHD4Q14839 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHD4Q14839 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHD4Q14839 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHD4Q14839 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHD4Q14839 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHD4Q14839 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHD4Q14839 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHD4Q14839 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHD4Q14839 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHD4Q14839 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHD4Q14839 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHD4Q14839 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHD4Q14839 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHD4Q14839 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHD4Q14839 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHD4Q14839 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHD4Q14839 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHD4Q14839 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHD4Q14839 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHD4Q14839 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHD4Q14839 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CHD4Q14839 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHD4Q14839 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHD4Q14839 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHD4Q14839 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHD4Q14839 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CHD4Q14839 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHD4Q14839 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CHD4Q14839 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHD4Q14839 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHD4Q14839 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHD4Q14839 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHD4Q14839 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHD4Q14839 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHD4Q14839 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHD4Q14839 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHD4Q14839 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHD4Q14839 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHD4Q14839 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHD4Q14839 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHD4Q14839 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHD4Q14839 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHD4Q14839 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHD4Q14839 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHD4Q14839 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHD4Q14839 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHD4Q14839 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHD4Q14839 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHD4Q14839 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHD4Q14839 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CHD4Q14839 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHD4Q14839 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHD4Q14839 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHD4Q14839 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHD4Q14839 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHD4Q14839 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHD4Q14839 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHD4Q14839 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHD4Q14839 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHD4Q14839 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHD4Q14839 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHD4Q14839 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHD4Q14839 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CHD4Q14839 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHD4Q14839 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHD4Q14839 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHD4Q14839 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHD4Q14839 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHD4Q14839 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CHD4Q14839 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHD4Q14839 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHD4Q14839 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHD4Q14839 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHD4Q14839 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHD4Q14839 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CHD4Q14839 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHD4Q14839 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHD4Q14839 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHD4Q14839 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CHD4Q14839 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CHD4Q14839 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CHD4Q14839 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CHD4Q14839 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CHD4Q14839 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CHD4Q14839 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CHD4Q14839 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
CHD4Q14839 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CHD4Q14839 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CHD4Q14839 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHD4Q14839 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHD4Q14839 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHD4Q14839 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHD4Q14839 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHD4Q14839 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHD4Q14839 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHD4Q14839 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
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