Protein–RNA interactions for Protein: Q14541

HNF4G, Hepatocyte nuclear factor 4-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNF4GQ14541 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HNF4GQ14541 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HNF4GQ14541 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HNF4GQ14541 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HNF4GQ14541 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HNF4GQ14541 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HNF4GQ14541 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HNF4GQ14541 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HNF4GQ14541 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HNF4GQ14541 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HNF4GQ14541 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HNF4GQ14541 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HNF4GQ14541 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HNF4GQ14541 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HNF4GQ14541 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HNF4GQ14541 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HNF4GQ14541 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HNF4GQ14541 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HNF4GQ14541 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HNF4GQ14541 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HNF4GQ14541 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HNF4GQ14541 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HNF4GQ14541 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HNF4GQ14541 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HNF4GQ14541 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HNF4GQ14541 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HNF4GQ14541 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HNF4GQ14541 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HNF4GQ14541 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HNF4GQ14541 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HNF4GQ14541 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HNF4GQ14541 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HNF4GQ14541 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HNF4GQ14541 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HNF4GQ14541 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HNF4GQ14541 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HNF4GQ14541 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HNF4GQ14541 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HNF4GQ14541 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HNF4GQ14541 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HNF4GQ14541 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HNF4GQ14541 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HNF4GQ14541 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HNF4GQ14541 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HNF4GQ14541 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HNF4GQ14541 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HNF4GQ14541 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HNF4GQ14541 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HNF4GQ14541 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HNF4GQ14541 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HNF4GQ14541 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HNF4GQ14541 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HNF4GQ14541 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HNF4GQ14541 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HNF4GQ14541 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HNF4GQ14541 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HNF4GQ14541 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HNF4GQ14541 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HNF4GQ14541 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HNF4GQ14541 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HNF4GQ14541 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HNF4GQ14541 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HNF4GQ14541 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HNF4GQ14541 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HNF4GQ14541 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HNF4GQ14541 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HNF4GQ14541 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HNF4GQ14541 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HNF4GQ14541 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HNF4GQ14541 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HNF4GQ14541 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HNF4GQ14541 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HNF4GQ14541 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HNF4GQ14541 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HNF4GQ14541 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HNF4GQ14541 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HNF4GQ14541 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HNF4GQ14541 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HNF4GQ14541 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HNF4GQ14541 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HNF4GQ14541 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HNF4GQ14541 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HNF4GQ14541 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HNF4GQ14541 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HNF4GQ14541 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HNF4GQ14541 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HNF4GQ14541 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HNF4GQ14541 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HNF4GQ14541 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HNF4GQ14541 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HNF4GQ14541 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HNF4GQ14541 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HNF4GQ14541 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HNF4GQ14541 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HNF4GQ14541 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HNF4GQ14541 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HNF4GQ14541 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HNF4GQ14541 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HNF4GQ14541 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HNF4GQ14541 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms