Protein–RNA interactions for Protein: Q14457

BECN1, Beclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN1Q14457 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BECN1Q14457 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BECN1Q14457 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BECN1Q14457 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BECN1Q14457 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BECN1Q14457 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BECN1Q14457 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BECN1Q14457 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BECN1Q14457 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BECN1Q14457 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BECN1Q14457 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BECN1Q14457 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BECN1Q14457 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BECN1Q14457 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BECN1Q14457 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
BECN1Q14457 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
BECN1Q14457 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BECN1Q14457 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BECN1Q14457 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BECN1Q14457 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BECN1Q14457 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BECN1Q14457 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BECN1Q14457 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BECN1Q14457 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BECN1Q14457 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BECN1Q14457 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BECN1Q14457 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BECN1Q14457 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BECN1Q14457 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BECN1Q14457 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BECN1Q14457 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BECN1Q14457 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BECN1Q14457 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BECN1Q14457 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BECN1Q14457 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BECN1Q14457 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BECN1Q14457 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BECN1Q14457 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BECN1Q14457 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BECN1Q14457 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BECN1Q14457 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BECN1Q14457 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BECN1Q14457 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BECN1Q14457 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BECN1Q14457 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
BECN1Q14457 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
BECN1Q14457 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
BECN1Q14457 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
BECN1Q14457 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
BECN1Q14457 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BECN1Q14457 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BECN1Q14457 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BECN1Q14457 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BECN1Q14457 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BECN1Q14457 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BECN1Q14457 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BECN1Q14457 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BECN1Q14457 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BECN1Q14457 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
BECN1Q14457 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BECN1Q14457 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BECN1Q14457 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
BECN1Q14457 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BECN1Q14457 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BECN1Q14457 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BECN1Q14457 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BECN1Q14457 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BECN1Q14457 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BECN1Q14457 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
BECN1Q14457 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BECN1Q14457 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BECN1Q14457 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BECN1Q14457 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BECN1Q14457 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
BECN1Q14457 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BECN1Q14457 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BECN1Q14457 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BECN1Q14457 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BECN1Q14457 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BECN1Q14457 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BECN1Q14457 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BECN1Q14457 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BECN1Q14457 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BECN1Q14457 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BECN1Q14457 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BECN1Q14457 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BECN1Q14457 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BECN1Q14457 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BECN1Q14457 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BECN1Q14457 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BECN1Q14457 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BECN1Q14457 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BECN1Q14457 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BECN1Q14457 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BECN1Q14457 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BECN1Q14457 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BECN1Q14457 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BECN1Q14457 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BECN1Q14457 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BECN1Q14457 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms