Protein–RNA interactions for Protein: Q14213

EBI3, Interleukin-27 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBI3Q14213 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
EBI3Q14213 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
EBI3Q14213 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
EBI3Q14213 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
EBI3Q14213 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
EBI3Q14213 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EBI3Q14213 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EBI3Q14213 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EBI3Q14213 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EBI3Q14213 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EBI3Q14213 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EBI3Q14213 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EBI3Q14213 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EBI3Q14213 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EBI3Q14213 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EBI3Q14213 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EBI3Q14213 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EBI3Q14213 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EBI3Q14213 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EBI3Q14213 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EBI3Q14213 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
EBI3Q14213 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EBI3Q14213 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EBI3Q14213 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EBI3Q14213 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EBI3Q14213 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EBI3Q14213 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EBI3Q14213 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EBI3Q14213 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EBI3Q14213 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EBI3Q14213 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EBI3Q14213 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EBI3Q14213 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EBI3Q14213 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EBI3Q14213 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
EBI3Q14213 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EBI3Q14213 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EBI3Q14213 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EBI3Q14213 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EBI3Q14213 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EBI3Q14213 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EBI3Q14213 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EBI3Q14213 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EBI3Q14213 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EBI3Q14213 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EBI3Q14213 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EBI3Q14213 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EBI3Q14213 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EBI3Q14213 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EBI3Q14213 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EBI3Q14213 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EBI3Q14213 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EBI3Q14213 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EBI3Q14213 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
EBI3Q14213 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
EBI3Q14213 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EBI3Q14213 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EBI3Q14213 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EBI3Q14213 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EBI3Q14213 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EBI3Q14213 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EBI3Q14213 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EBI3Q14213 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EBI3Q14213 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EBI3Q14213 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EBI3Q14213 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
EBI3Q14213 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EBI3Q14213 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EBI3Q14213 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EBI3Q14213 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EBI3Q14213 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EBI3Q14213 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EBI3Q14213 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EBI3Q14213 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EBI3Q14213 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EBI3Q14213 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EBI3Q14213 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EBI3Q14213 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EBI3Q14213 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EBI3Q14213 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EBI3Q14213 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EBI3Q14213 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EBI3Q14213 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EBI3Q14213 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
EBI3Q14213 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EBI3Q14213 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EBI3Q14213 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EBI3Q14213 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EBI3Q14213 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EBI3Q14213 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EBI3Q14213 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EBI3Q14213 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EBI3Q14213 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EBI3Q14213 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EBI3Q14213 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EBI3Q14213 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EBI3Q14213 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EBI3Q14213 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EBI3Q14213 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EBI3Q14213 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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