Protein–RNA interactions for Protein: Q13946

PDE7A, High affinity cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 7A, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE7AQ13946 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDE7AQ13946 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDE7AQ13946 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDE7AQ13946 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDE7AQ13946 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDE7AQ13946 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDE7AQ13946 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDE7AQ13946 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDE7AQ13946 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDE7AQ13946 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDE7AQ13946 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PDE7AQ13946 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDE7AQ13946 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDE7AQ13946 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDE7AQ13946 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDE7AQ13946 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDE7AQ13946 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDE7AQ13946 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PDE7AQ13946 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDE7AQ13946 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDE7AQ13946 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDE7AQ13946 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDE7AQ13946 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDE7AQ13946 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDE7AQ13946 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDE7AQ13946 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDE7AQ13946 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDE7AQ13946 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDE7AQ13946 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDE7AQ13946 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDE7AQ13946 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDE7AQ13946 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDE7AQ13946 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PDE7AQ13946 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDE7AQ13946 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDE7AQ13946 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDE7AQ13946 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDE7AQ13946 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PDE7AQ13946 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDE7AQ13946 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDE7AQ13946 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PDE7AQ13946 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PDE7AQ13946 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDE7AQ13946 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDE7AQ13946 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDE7AQ13946 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDE7AQ13946 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDE7AQ13946 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDE7AQ13946 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDE7AQ13946 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDE7AQ13946 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDE7AQ13946 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDE7AQ13946 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDE7AQ13946 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDE7AQ13946 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDE7AQ13946 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDE7AQ13946 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDE7AQ13946 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDE7AQ13946 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDE7AQ13946 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDE7AQ13946 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDE7AQ13946 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDE7AQ13946 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDE7AQ13946 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDE7AQ13946 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDE7AQ13946 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDE7AQ13946 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PDE7AQ13946 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDE7AQ13946 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDE7AQ13946 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDE7AQ13946 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDE7AQ13946 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDE7AQ13946 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDE7AQ13946 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDE7AQ13946 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDE7AQ13946 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDE7AQ13946 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PDE7AQ13946 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDE7AQ13946 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PDE7AQ13946 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDE7AQ13946 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDE7AQ13946 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDE7AQ13946 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDE7AQ13946 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDE7AQ13946 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PDE7AQ13946 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDE7AQ13946 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDE7AQ13946 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDE7AQ13946 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDE7AQ13946 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDE7AQ13946 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDE7AQ13946 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDE7AQ13946 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDE7AQ13946 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PDE7AQ13946 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PDE7AQ13946 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
PDE7AQ13946 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PDE7AQ13946 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PDE7AQ13946 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PDE7AQ13946 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms