Protein–RNA interactions for Protein: Q13938

CAPS, Calcyphosin, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPSQ13938 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CAPSQ13938 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CAPSQ13938 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CAPSQ13938 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CAPSQ13938 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CAPSQ13938 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CAPSQ13938 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CAPSQ13938 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CAPSQ13938 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CAPSQ13938 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CAPSQ13938 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CAPSQ13938 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CAPSQ13938 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CAPSQ13938 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
CAPSQ13938 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CAPSQ13938 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
CAPSQ13938 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
CAPSQ13938 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CAPSQ13938 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CAPSQ13938 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CAPSQ13938 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CAPSQ13938 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CAPSQ13938 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CAPSQ13938 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CAPSQ13938 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CAPSQ13938 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CAPSQ13938 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CAPSQ13938 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CAPSQ13938 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CAPSQ13938 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CAPSQ13938 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CAPSQ13938 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CAPSQ13938 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CAPSQ13938 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CAPSQ13938 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CAPSQ13938 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CAPSQ13938 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CAPSQ13938 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CAPSQ13938 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CAPSQ13938 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CAPSQ13938 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CAPSQ13938 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CAPSQ13938 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CAPSQ13938 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CAPSQ13938 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
CAPSQ13938 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CAPSQ13938 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CAPSQ13938 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
CAPSQ13938 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CAPSQ13938 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CAPSQ13938 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CAPSQ13938 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CAPSQ13938 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CAPSQ13938 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CAPSQ13938 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CAPSQ13938 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CAPSQ13938 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CAPSQ13938 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CAPSQ13938 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CAPSQ13938 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CAPSQ13938 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CAPSQ13938 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CAPSQ13938 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CAPSQ13938 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CAPSQ13938 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CAPSQ13938 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CAPSQ13938 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CAPSQ13938 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CAPSQ13938 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CAPSQ13938 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CAPSQ13938 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CAPSQ13938 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CAPSQ13938 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CAPSQ13938 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CAPSQ13938 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CAPSQ13938 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CAPSQ13938 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CAPSQ13938 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CAPSQ13938 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CAPSQ13938 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
CAPSQ13938 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
CAPSQ13938 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CAPSQ13938 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CAPSQ13938 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
CAPSQ13938 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CAPSQ13938 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CAPSQ13938 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CAPSQ13938 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CAPSQ13938 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CAPSQ13938 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CAPSQ13938 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CAPSQ13938 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CAPSQ13938 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CAPSQ13938 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CAPSQ13938 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CAPSQ13938 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CAPSQ13938 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CAPSQ13938 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CAPSQ13938 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CAPSQ13938 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms