Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPTAN1Q13813 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPTAN1Q13813 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SPTAN1Q13813 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SPTAN1Q13813 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPTAN1Q13813 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPTAN1Q13813 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPTAN1Q13813 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPTAN1Q13813 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPTAN1Q13813 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SPTAN1Q13813 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPTAN1Q13813 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SPTAN1Q13813 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPTAN1Q13813 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPTAN1Q13813 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPTAN1Q13813 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPTAN1Q13813 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPTAN1Q13813 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPTAN1Q13813 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPTAN1Q13813 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPTAN1Q13813 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPTAN1Q13813 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPTAN1Q13813 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPTAN1Q13813 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPTAN1Q13813 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPTAN1Q13813 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPTAN1Q13813 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPTAN1Q13813 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SPTAN1Q13813 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPTAN1Q13813 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPTAN1Q13813 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPTAN1Q13813 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SPTAN1Q13813 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPTAN1Q13813 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPTAN1Q13813 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SPTAN1Q13813 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SPTAN1Q13813 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPTAN1Q13813 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPTAN1Q13813 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPTAN1Q13813 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPTAN1Q13813 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPTAN1Q13813 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPTAN1Q13813 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPTAN1Q13813 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPTAN1Q13813 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPTAN1Q13813 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPTAN1Q13813 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPTAN1Q13813 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPTAN1Q13813 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPTAN1Q13813 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPTAN1Q13813 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPTAN1Q13813 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPTAN1Q13813 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPTAN1Q13813 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPTAN1Q13813 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPTAN1Q13813 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPTAN1Q13813 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPTAN1Q13813 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SPTAN1Q13813 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPTAN1Q13813 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPTAN1Q13813 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPTAN1Q13813 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SPTAN1Q13813 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPTAN1Q13813 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPTAN1Q13813 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPTAN1Q13813 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPTAN1Q13813 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPTAN1Q13813 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPTAN1Q13813 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPTAN1Q13813 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPTAN1Q13813 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPTAN1Q13813 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPTAN1Q13813 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SPTAN1Q13813 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPTAN1Q13813 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SPTAN1Q13813 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SPTAN1Q13813 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPTAN1Q13813 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPTAN1Q13813 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPTAN1Q13813 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPTAN1Q13813 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SPTAN1Q13813 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPTAN1Q13813 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPTAN1Q13813 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPTAN1Q13813 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPTAN1Q13813 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPTAN1Q13813 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SPTAN1Q13813 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SPTAN1Q13813 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SPTAN1Q13813 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SPTAN1Q13813 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SPTAN1Q13813 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SPTAN1Q13813 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SPTAN1Q13813 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SPTAN1Q13813 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SPTAN1Q13813 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SPTAN1Q13813 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
SPTAN1Q13813 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SPTAN1Q13813 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPTAN1Q13813 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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