Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOFQ13790 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOFQ13790 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOFQ13790 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOFQ13790 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOFQ13790 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOFQ13790 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
APOFQ13790 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOFQ13790 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOFQ13790 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOFQ13790 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOFQ13790 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOFQ13790 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOFQ13790 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOFQ13790 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOFQ13790 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOFQ13790 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
APOFQ13790 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOFQ13790 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOFQ13790 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOFQ13790 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOFQ13790 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
APOFQ13790 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOFQ13790 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOFQ13790 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOFQ13790 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOFQ13790 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOFQ13790 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOFQ13790 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOFQ13790 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOFQ13790 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOFQ13790 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOFQ13790 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOFQ13790 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOFQ13790 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
APOFQ13790 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
APOFQ13790 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOFQ13790 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOFQ13790 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOFQ13790 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOFQ13790 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOFQ13790 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOFQ13790 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOFQ13790 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOFQ13790 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOFQ13790 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOFQ13790 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOFQ13790 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOFQ13790 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
APOFQ13790 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOFQ13790 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOFQ13790 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOFQ13790 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOFQ13790 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOFQ13790 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOFQ13790 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOFQ13790 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOFQ13790 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOFQ13790 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOFQ13790 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOFQ13790 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOFQ13790 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOFQ13790 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOFQ13790 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOFQ13790 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOFQ13790 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOFQ13790 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOFQ13790 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
APOFQ13790 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOFQ13790 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOFQ13790 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOFQ13790 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
APOFQ13790 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOFQ13790 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOFQ13790 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOFQ13790 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOFQ13790 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOFQ13790 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOFQ13790 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOFQ13790 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOFQ13790 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOFQ13790 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOFQ13790 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOFQ13790 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOFQ13790 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOFQ13790 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOFQ13790 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOFQ13790 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOFQ13790 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOFQ13790 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOFQ13790 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOFQ13790 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
APOFQ13790 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOFQ13790 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOFQ13790 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
APOFQ13790 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOFQ13790 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOFQ13790 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOFQ13790 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOFQ13790 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
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