Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTCH1Q13635 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTCH1Q13635 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTCH1Q13635 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTCH1Q13635 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTCH1Q13635 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTCH1Q13635 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTCH1Q13635 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTCH1Q13635 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTCH1Q13635 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTCH1Q13635 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTCH1Q13635 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTCH1Q13635 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTCH1Q13635 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
PTCH1Q13635 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTCH1Q13635 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
PTCH1Q13635 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTCH1Q13635 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTCH1Q13635 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTCH1Q13635 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTCH1Q13635 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTCH1Q13635 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTCH1Q13635 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTCH1Q13635 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTCH1Q13635 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTCH1Q13635 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTCH1Q13635 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTCH1Q13635 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTCH1Q13635 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTCH1Q13635 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTCH1Q13635 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
PTCH1Q13635 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
PTCH1Q13635 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTCH1Q13635 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTCH1Q13635 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTCH1Q13635 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTCH1Q13635 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTCH1Q13635 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTCH1Q13635 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTCH1Q13635 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTCH1Q13635 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTCH1Q13635 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTCH1Q13635 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTCH1Q13635 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTCH1Q13635 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTCH1Q13635 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTCH1Q13635 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTCH1Q13635 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
PTCH1Q13635 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTCH1Q13635 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTCH1Q13635 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
PTCH1Q13635 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTCH1Q13635 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTCH1Q13635 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTCH1Q13635 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTCH1Q13635 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTCH1Q13635 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTCH1Q13635 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTCH1Q13635 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTCH1Q13635 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
PTCH1Q13635 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTCH1Q13635 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTCH1Q13635 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTCH1Q13635 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTCH1Q13635 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
PTCH1Q13635 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PTCH1Q13635 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PTCH1Q13635 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PTCH1Q13635 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PTCH1Q13635 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PTCH1Q13635 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PTCH1Q13635 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PTCH1Q13635 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PTCH1Q13635 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
PTCH1Q13635 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PTCH1Q13635 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PTCH1Q13635 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PTCH1Q13635 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PTCH1Q13635 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PTCH1Q13635 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
PTCH1Q13635 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.85
PTCH1Q13635 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PTCH1Q13635 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
PTCH1Q13635 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC26.64■■□□□ 1.85
PTCH1Q13635 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC26.64■■□□□ 1.85
PTCH1Q13635 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
PTCH1Q13635 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
PTCH1Q13635 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PTCH1Q13635 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PTCH1Q13635 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTCH1Q13635 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTCH1Q13635 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTCH1Q13635 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTCH1Q13635 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTCH1Q13635 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTCH1Q13635 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTCH1Q13635 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTCH1Q13635 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
PTCH1Q13635 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTCH1Q13635 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
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