Protein–RNA interactions for Protein: Q13523

PRPF4B, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4BQ13523 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRPF4BQ13523 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRPF4BQ13523 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRPF4BQ13523 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PRPF4BQ13523 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRPF4BQ13523 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRPF4BQ13523 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRPF4BQ13523 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRPF4BQ13523 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRPF4BQ13523 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRPF4BQ13523 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRPF4BQ13523 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRPF4BQ13523 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRPF4BQ13523 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRPF4BQ13523 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRPF4BQ13523 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRPF4BQ13523 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRPF4BQ13523 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRPF4BQ13523 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRPF4BQ13523 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRPF4BQ13523 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRPF4BQ13523 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRPF4BQ13523 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRPF4BQ13523 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRPF4BQ13523 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRPF4BQ13523 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRPF4BQ13523 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRPF4BQ13523 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRPF4BQ13523 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PRPF4BQ13523 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PRPF4BQ13523 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PRPF4BQ13523 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRPF4BQ13523 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRPF4BQ13523 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRPF4BQ13523 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRPF4BQ13523 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PRPF4BQ13523 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRPF4BQ13523 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRPF4BQ13523 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PRPF4BQ13523 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRPF4BQ13523 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRPF4BQ13523 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRPF4BQ13523 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRPF4BQ13523 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRPF4BQ13523 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRPF4BQ13523 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
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PRPF4BQ13523 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRPF4BQ13523 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRPF4BQ13523 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRPF4BQ13523 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRPF4BQ13523 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRPF4BQ13523 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PRPF4BQ13523 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRPF4BQ13523 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRPF4BQ13523 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRPF4BQ13523 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRPF4BQ13523 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRPF4BQ13523 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
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PRPF4BQ13523 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRPF4BQ13523 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRPF4BQ13523 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRPF4BQ13523 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRPF4BQ13523 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRPF4BQ13523 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
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PRPF4BQ13523 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRPF4BQ13523 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRPF4BQ13523 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRPF4BQ13523 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRPF4BQ13523 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
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PRPF4BQ13523 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
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PRPF4BQ13523 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRPF4BQ13523 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRPF4BQ13523 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRPF4BQ13523 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRPF4BQ13523 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRPF4BQ13523 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
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PRPF4BQ13523 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PRPF4BQ13523 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRPF4BQ13523 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRPF4BQ13523 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRPF4BQ13523 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRPF4BQ13523 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRPF4BQ13523 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRPF4BQ13523 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRPF4BQ13523 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRPF4BQ13523 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRPF4BQ13523 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRPF4BQ13523 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRPF4BQ13523 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PRPF4BQ13523 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRPF4BQ13523 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRPF4BQ13523 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
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