Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SEMA3FQ13275 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SEMA3FQ13275 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SEMA3FQ13275 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SEMA3FQ13275 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SEMA3FQ13275 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SEMA3FQ13275 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SEMA3FQ13275 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SEMA3FQ13275 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SEMA3FQ13275 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SEMA3FQ13275 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SEMA3FQ13275 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SEMA3FQ13275 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SEMA3FQ13275 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SEMA3FQ13275 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SEMA3FQ13275 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SEMA3FQ13275 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SEMA3FQ13275 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SEMA3FQ13275 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SEMA3FQ13275 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SEMA3FQ13275 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SEMA3FQ13275 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SEMA3FQ13275 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SEMA3FQ13275 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SEMA3FQ13275 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SEMA3FQ13275 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SEMA3FQ13275 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SEMA3FQ13275 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SEMA3FQ13275 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SEMA3FQ13275 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SEMA3FQ13275 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SEMA3FQ13275 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SEMA3FQ13275 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SEMA3FQ13275 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SEMA3FQ13275 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SEMA3FQ13275 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SEMA3FQ13275 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SEMA3FQ13275 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SEMA3FQ13275 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SEMA3FQ13275 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SEMA3FQ13275 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SEMA3FQ13275 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SEMA3FQ13275 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SEMA3FQ13275 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SEMA3FQ13275 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SEMA3FQ13275 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SEMA3FQ13275 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SEMA3FQ13275 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SEMA3FQ13275 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SEMA3FQ13275 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SEMA3FQ13275 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SEMA3FQ13275 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SEMA3FQ13275 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SEMA3FQ13275 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SEMA3FQ13275 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SEMA3FQ13275 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SEMA3FQ13275 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SEMA3FQ13275 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
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SEMA3FQ13275 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SEMA3FQ13275 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SEMA3FQ13275 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SEMA3FQ13275 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SEMA3FQ13275 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SEMA3FQ13275 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
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SEMA3FQ13275 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SEMA3FQ13275 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SEMA3FQ13275 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
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SEMA3FQ13275 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
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SEMA3FQ13275 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SEMA3FQ13275 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SEMA3FQ13275 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SEMA3FQ13275 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SEMA3FQ13275 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SEMA3FQ13275 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SEMA3FQ13275 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SEMA3FQ13275 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SEMA3FQ13275 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SEMA3FQ13275 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SEMA3FQ13275 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SEMA3FQ13275 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SEMA3FQ13275 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SEMA3FQ13275 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SEMA3FQ13275 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SEMA3FQ13275 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SEMA3FQ13275 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SEMA3FQ13275 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SEMA3FQ13275 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SEMA3FQ13275 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SEMA3FQ13275 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SEMA3FQ13275 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SEMA3FQ13275 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SEMA3FQ13275 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SEMA3FQ13275 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SEMA3FQ13275 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
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