Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

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Length 568 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAF3Q13114 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAF3Q13114 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAF3Q13114 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAF3Q13114 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAF3Q13114 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAF3Q13114 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAF3Q13114 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAF3Q13114 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAF3Q13114 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAF3Q13114 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAF3Q13114 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAF3Q13114 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAF3Q13114 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAF3Q13114 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAF3Q13114 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAF3Q13114 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
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TRAF3Q13114 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAF3Q13114 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAF3Q13114 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAF3Q13114 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAF3Q13114 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAF3Q13114 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAF3Q13114 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAF3Q13114 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAF3Q13114 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAF3Q13114 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAF3Q13114 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAF3Q13114 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAF3Q13114 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAF3Q13114 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAF3Q13114 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAF3Q13114 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAF3Q13114 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAF3Q13114 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAF3Q13114 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAF3Q13114 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
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TRAF3Q13114 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
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TRAF3Q13114 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
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TRAF3Q13114 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
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TRAF3Q13114 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
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TRAF3Q13114 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRAF3Q13114 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
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TRAF3Q13114 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRAF3Q13114 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
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TRAF3Q13114 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
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TRAF3Q13114 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
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TRAF3Q13114 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAF3Q13114 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAF3Q13114 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAF3Q13114 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAF3Q13114 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAF3Q13114 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAF3Q13114 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAF3Q13114 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAF3Q13114 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAF3Q13114 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAF3Q13114 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAF3Q13114 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAF3Q13114 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAF3Q13114 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAF3Q13114 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAF3Q13114 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAF3Q13114 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAF3Q13114 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAF3Q13114 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAF3Q13114 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAF3Q13114 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAF3Q13114 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
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