Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAF1Q13077 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAF1Q13077 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAF1Q13077 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAF1Q13077 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAF1Q13077 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAF1Q13077 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAF1Q13077 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAF1Q13077 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAF1Q13077 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAF1Q13077 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAF1Q13077 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAF1Q13077 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAF1Q13077 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAF1Q13077 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAF1Q13077 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAF1Q13077 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAF1Q13077 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAF1Q13077 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAF1Q13077 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAF1Q13077 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAF1Q13077 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAF1Q13077 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAF1Q13077 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAF1Q13077 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
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TRAF1Q13077 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAF1Q13077 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAF1Q13077 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAF1Q13077 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAF1Q13077 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAF1Q13077 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAF1Q13077 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
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TRAF1Q13077 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
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TRAF1Q13077 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
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TRAF1Q13077 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
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TRAF1Q13077 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
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TRAF1Q13077 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
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TRAF1Q13077 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
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TRAF1Q13077 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
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TRAF1Q13077 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
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TRAF1Q13077 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRAF1Q13077 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
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TRAF1Q13077 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRAF1Q13077 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRAF1Q13077 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRAF1Q13077 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRAF1Q13077 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRAF1Q13077 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAF1Q13077 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAF1Q13077 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAF1Q13077 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAF1Q13077 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
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