Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

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Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
PRDM2Q13029 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
PRDM2Q13029 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
PRDM2Q13029 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
PRDM2Q13029 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
PRDM2Q13029 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC32.71■■■□□ 2.83
PRDM2Q13029 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
PRDM2Q13029 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
PRDM2Q13029 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
PRDM2Q13029 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
PRDM2Q13029 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
PRDM2Q13029 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
PRDM2Q13029 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
PRDM2Q13029 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC32.7■■■□□ 2.82
PRDM2Q13029 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC32.7■■■□□ 2.82
PRDM2Q13029 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
PRDM2Q13029 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.82
PRDM2Q13029 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
PRDM2Q13029 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
PRDM2Q13029 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
PRDM2Q13029 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC32.69■■■□□ 2.82
PRDM2Q13029 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
PRDM2Q13029 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
PRDM2Q13029 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
PRDM2Q13029 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
PRDM2Q13029 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
PRDM2Q13029 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
PRDM2Q13029 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
PRDM2Q13029 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
PRDM2Q13029 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
PRDM2Q13029 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
PRDM2Q13029 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
PRDM2Q13029 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
PRDM2Q13029 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
PRDM2Q13029 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
PRDM2Q13029 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
PRDM2Q13029 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
PRDM2Q13029 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
PRDM2Q13029 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
PRDM2Q13029 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
PRDM2Q13029 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
PRDM2Q13029 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
PRDM2Q13029 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC32.67■■■□□ 2.82
PRDM2Q13029 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
PRDM2Q13029 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
PRDM2Q13029 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
PRDM2Q13029 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
PRDM2Q13029 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
PRDM2Q13029 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
PRDM2Q13029 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
PRDM2Q13029 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
PRDM2Q13029 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC32.66■■■□□ 2.82
PRDM2Q13029 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
PRDM2Q13029 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
PRDM2Q13029 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
PRDM2Q13029 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
PRDM2Q13029 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
PRDM2Q13029 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
PRDM2Q13029 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
PRDM2Q13029 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
PRDM2Q13029 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
PRDM2Q13029 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
PRDM2Q13029 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
PRDM2Q13029 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
PRDM2Q13029 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
PRDM2Q13029 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC32.65■■■□□ 2.82
PRDM2Q13029 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
PRDM2Q13029 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.65■■■□□ 2.82
PRDM2Q13029 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
PRDM2Q13029 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
PRDM2Q13029 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
PRDM2Q13029 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
PRDM2Q13029 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
PRDM2Q13029 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
PRDM2Q13029 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
PRDM2Q13029 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
PRDM2Q13029 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
PRDM2Q13029 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
PRDM2Q13029 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC32.64■■■□□ 2.82
PRDM2Q13029 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
PRDM2Q13029 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
PRDM2Q13029 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.63■■■□□ 2.81
PRDM2Q13029 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
PRDM2Q13029 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
PRDM2Q13029 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC32.63■■■□□ 2.81
PRDM2Q13029 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC32.63■■■□□ 2.81
PRDM2Q13029 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
PRDM2Q13029 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
PRDM2Q13029 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
PRDM2Q13029 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
PRDM2Q13029 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
PRDM2Q13029 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
PRDM2Q13029 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
PRDM2Q13029 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
PRDM2Q13029 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
PRDM2Q13029 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
PRDM2Q13029 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
PRDM2Q13029 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
PRDM2Q13029 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
PRDM2Q13029 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
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