Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HSPB3Q12988 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
HSPB3Q12988 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HSPB3Q12988 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HSPB3Q12988 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HSPB3Q12988 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HSPB3Q12988 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HSPB3Q12988 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HSPB3Q12988 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HSPB3Q12988 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HSPB3Q12988 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HSPB3Q12988 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HSPB3Q12988 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HSPB3Q12988 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HSPB3Q12988 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HSPB3Q12988 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HSPB3Q12988 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HSPB3Q12988 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HSPB3Q12988 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HSPB3Q12988 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HSPB3Q12988 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HSPB3Q12988 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HSPB3Q12988 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HSPB3Q12988 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HSPB3Q12988 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HSPB3Q12988 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HSPB3Q12988 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
HSPB3Q12988 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HSPB3Q12988 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HSPB3Q12988 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HSPB3Q12988 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HSPB3Q12988 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HSPB3Q12988 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HSPB3Q12988 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HSPB3Q12988 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HSPB3Q12988 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HSPB3Q12988 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HSPB3Q12988 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HSPB3Q12988 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HSPB3Q12988 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HSPB3Q12988 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HSPB3Q12988 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HSPB3Q12988 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HSPB3Q12988 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HSPB3Q12988 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HSPB3Q12988 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HSPB3Q12988 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HSPB3Q12988 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HSPB3Q12988 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HSPB3Q12988 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HSPB3Q12988 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HSPB3Q12988 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HSPB3Q12988 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HSPB3Q12988 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HSPB3Q12988 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HSPB3Q12988 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HSPB3Q12988 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HSPB3Q12988 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HSPB3Q12988 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
HSPB3Q12988 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HSPB3Q12988 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HSPB3Q12988 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HSPB3Q12988 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HSPB3Q12988 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HSPB3Q12988 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HSPB3Q12988 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HSPB3Q12988 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HSPB3Q12988 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HSPB3Q12988 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HSPB3Q12988 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HSPB3Q12988 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HSPB3Q12988 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HSPB3Q12988 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HSPB3Q12988 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HSPB3Q12988 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HSPB3Q12988 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HSPB3Q12988 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HSPB3Q12988 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HSPB3Q12988 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HSPB3Q12988 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HSPB3Q12988 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HSPB3Q12988 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HSPB3Q12988 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HSPB3Q12988 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HSPB3Q12988 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HSPB3Q12988 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HSPB3Q12988 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HSPB3Q12988 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HSPB3Q12988 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
HSPB3Q12988 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HSPB3Q12988 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HSPB3Q12988 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
HSPB3Q12988 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HSPB3Q12988 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HSPB3Q12988 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HSPB3Q12988 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HSPB3Q12988 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HSPB3Q12988 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HSPB3Q12988 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HSPB3Q12988 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
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