Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FOXF2Q12947 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FOXF2Q12947 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FOXF2Q12947 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FOXF2Q12947 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FOXF2Q12947 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
FOXF2Q12947 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
FOXF2Q12947 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FOXF2Q12947 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FOXF2Q12947 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FOXF2Q12947 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FOXF2Q12947 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FOXF2Q12947 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FOXF2Q12947 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FOXF2Q12947 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FOXF2Q12947 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FOXF2Q12947 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FOXF2Q12947 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FOXF2Q12947 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FOXF2Q12947 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FOXF2Q12947 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FOXF2Q12947 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FOXF2Q12947 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FOXF2Q12947 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FOXF2Q12947 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FOXF2Q12947 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FOXF2Q12947 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FOXF2Q12947 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FOXF2Q12947 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FOXF2Q12947 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FOXF2Q12947 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FOXF2Q12947 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FOXF2Q12947 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FOXF2Q12947 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FOXF2Q12947 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FOXF2Q12947 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FOXF2Q12947 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FOXF2Q12947 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FOXF2Q12947 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FOXF2Q12947 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FOXF2Q12947 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FOXF2Q12947 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FOXF2Q12947 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXF2Q12947 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXF2Q12947 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXF2Q12947 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXF2Q12947 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXF2Q12947 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXF2Q12947 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXF2Q12947 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXF2Q12947 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXF2Q12947 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXF2Q12947 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXF2Q12947 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXF2Q12947 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXF2Q12947 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXF2Q12947 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXF2Q12947 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXF2Q12947 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXF2Q12947 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXF2Q12947 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXF2Q12947 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXF2Q12947 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXF2Q12947 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXF2Q12947 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXF2Q12947 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXF2Q12947 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXF2Q12947 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXF2Q12947 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXF2Q12947 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXF2Q12947 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXF2Q12947 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXF2Q12947 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXF2Q12947 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXF2Q12947 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXF2Q12947 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXF2Q12947 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXF2Q12947 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXF2Q12947 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FOXF2Q12947 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FOXF2Q12947 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FOXF2Q12947 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FOXF2Q12947 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
FOXF2Q12947 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FOXF2Q12947 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FOXF2Q12947 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FOXF2Q12947 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FOXF2Q12947 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FOXF2Q12947 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FOXF2Q12947 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FOXF2Q12947 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
FOXF2Q12947 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FOXF2Q12947 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
FOXF2Q12947 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
FOXF2Q12947 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
FOXF2Q12947 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FOXF2Q12947 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FOXF2Q12947 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FOXF2Q12947 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FOXF2Q12947 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms