Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LMAN2Q12907 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LMAN2Q12907 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
LMAN2Q12907 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LMAN2Q12907 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
LMAN2Q12907 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
LMAN2Q12907 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LMAN2Q12907 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LMAN2Q12907 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LMAN2Q12907 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LMAN2Q12907 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LMAN2Q12907 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LMAN2Q12907 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LMAN2Q12907 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
LMAN2Q12907 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
LMAN2Q12907 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
LMAN2Q12907 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
LMAN2Q12907 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
LMAN2Q12907 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
LMAN2Q12907 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
LMAN2Q12907 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LMAN2Q12907 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
LMAN2Q12907 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
LMAN2Q12907 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LMAN2Q12907 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
LMAN2Q12907 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
LMAN2Q12907 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
LMAN2Q12907 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LMAN2Q12907 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LMAN2Q12907 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LMAN2Q12907 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
LMAN2Q12907 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
LMAN2Q12907 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LMAN2Q12907 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LMAN2Q12907 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LMAN2Q12907 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LMAN2Q12907 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LMAN2Q12907 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LMAN2Q12907 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LMAN2Q12907 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LMAN2Q12907 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LMAN2Q12907 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LMAN2Q12907 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LMAN2Q12907 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LMAN2Q12907 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LMAN2Q12907 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
LMAN2Q12907 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LMAN2Q12907 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LMAN2Q12907 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LMAN2Q12907 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LMAN2Q12907 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LMAN2Q12907 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
LMAN2Q12907 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LMAN2Q12907 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LMAN2Q12907 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LMAN2Q12907 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LMAN2Q12907 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LMAN2Q12907 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LMAN2Q12907 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LMAN2Q12907 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LMAN2Q12907 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
LMAN2Q12907 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LMAN2Q12907 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LMAN2Q12907 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LMAN2Q12907 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LMAN2Q12907 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LMAN2Q12907 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LMAN2Q12907 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LMAN2Q12907 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LMAN2Q12907 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LMAN2Q12907 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LMAN2Q12907 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LMAN2Q12907 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
LMAN2Q12907 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LMAN2Q12907 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LMAN2Q12907 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
LMAN2Q12907 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LMAN2Q12907 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LMAN2Q12907 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LMAN2Q12907 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LMAN2Q12907 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LMAN2Q12907 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LMAN2Q12907 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LMAN2Q12907 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LMAN2Q12907 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LMAN2Q12907 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
LMAN2Q12907 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LMAN2Q12907 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
LMAN2Q12907 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LMAN2Q12907 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LMAN2Q12907 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
LMAN2Q12907 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LMAN2Q12907 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
LMAN2Q12907 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LMAN2Q12907 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LMAN2Q12907 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LMAN2Q12907 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LMAN2Q12907 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LMAN2Q12907 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LMAN2Q12907 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms