Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CNTN1Q12860 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CNTN1Q12860 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CNTN1Q12860 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CNTN1Q12860 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CNTN1Q12860 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CNTN1Q12860 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CNTN1Q12860 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CNTN1Q12860 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CNTN1Q12860 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CNTN1Q12860 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CNTN1Q12860 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CNTN1Q12860 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CNTN1Q12860 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CNTN1Q12860 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CNTN1Q12860 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CNTN1Q12860 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CNTN1Q12860 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CNTN1Q12860 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CNTN1Q12860 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CNTN1Q12860 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CNTN1Q12860 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CNTN1Q12860 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CNTN1Q12860 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CNTN1Q12860 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CNTN1Q12860 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CNTN1Q12860 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CNTN1Q12860 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CNTN1Q12860 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CNTN1Q12860 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CNTN1Q12860 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CNTN1Q12860 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CNTN1Q12860 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CNTN1Q12860 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CNTN1Q12860 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CNTN1Q12860 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CNTN1Q12860 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CNTN1Q12860 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CNTN1Q12860 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CNTN1Q12860 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CNTN1Q12860 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CNTN1Q12860 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CNTN1Q12860 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CNTN1Q12860 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CNTN1Q12860 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CNTN1Q12860 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CNTN1Q12860 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CNTN1Q12860 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CNTN1Q12860 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CNTN1Q12860 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CNTN1Q12860 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CNTN1Q12860 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CNTN1Q12860 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CNTN1Q12860 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CNTN1Q12860 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CNTN1Q12860 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CNTN1Q12860 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CNTN1Q12860 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CNTN1Q12860 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CNTN1Q12860 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CNTN1Q12860 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CNTN1Q12860 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CNTN1Q12860 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CNTN1Q12860 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CNTN1Q12860 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CNTN1Q12860 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CNTN1Q12860 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CNTN1Q12860 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CNTN1Q12860 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CNTN1Q12860 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CNTN1Q12860 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
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CNTN1Q12860 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CNTN1Q12860 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
CNTN1Q12860 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CNTN1Q12860 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CNTN1Q12860 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CNTN1Q12860 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CNTN1Q12860 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CNTN1Q12860 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CNTN1Q12860 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CNTN1Q12860 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CNTN1Q12860 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CNTN1Q12860 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CNTN1Q12860 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CNTN1Q12860 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CNTN1Q12860 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CNTN1Q12860 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CNTN1Q12860 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CNTN1Q12860 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CNTN1Q12860 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CNTN1Q12860 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CNTN1Q12860 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CNTN1Q12860 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CNTN1Q12860 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CNTN1Q12860 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CNTN1Q12860 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CNTN1Q12860 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CNTN1Q12860 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CNTN1Q12860 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
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