Protein–RNA interactions for Protein: Q12805

EFEMP1, EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFEMP1Q12805 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
EFEMP1Q12805 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
EFEMP1Q12805 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
EFEMP1Q12805 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EFEMP1Q12805 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
EFEMP1Q12805 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
EFEMP1Q12805 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EFEMP1Q12805 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EFEMP1Q12805 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EFEMP1Q12805 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EFEMP1Q12805 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
EFEMP1Q12805 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
EFEMP1Q12805 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
EFEMP1Q12805 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EFEMP1Q12805 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EFEMP1Q12805 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EFEMP1Q12805 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EFEMP1Q12805 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
EFEMP1Q12805 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
EFEMP1Q12805 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
EFEMP1Q12805 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EFEMP1Q12805 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
EFEMP1Q12805 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
EFEMP1Q12805 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EFEMP1Q12805 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
EFEMP1Q12805 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
EFEMP1Q12805 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EFEMP1Q12805 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
EFEMP1Q12805 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EFEMP1Q12805 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
EFEMP1Q12805 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EFEMP1Q12805 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EFEMP1Q12805 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
EFEMP1Q12805 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EFEMP1Q12805 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
EFEMP1Q12805 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EFEMP1Q12805 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
EFEMP1Q12805 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EFEMP1Q12805 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EFEMP1Q12805 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EFEMP1Q12805 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
EFEMP1Q12805 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EFEMP1Q12805 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
EFEMP1Q12805 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
EFEMP1Q12805 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EFEMP1Q12805 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
EFEMP1Q12805 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
EFEMP1Q12805 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
EFEMP1Q12805 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
EFEMP1Q12805 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
EFEMP1Q12805 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EFEMP1Q12805 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EFEMP1Q12805 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
EFEMP1Q12805 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
EFEMP1Q12805 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EFEMP1Q12805 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
EFEMP1Q12805 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EFEMP1Q12805 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
EFEMP1Q12805 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
EFEMP1Q12805 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
EFEMP1Q12805 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
EFEMP1Q12805 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
EFEMP1Q12805 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
EFEMP1Q12805 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EFEMP1Q12805 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
EFEMP1Q12805 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
EFEMP1Q12805 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
EFEMP1Q12805 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
EFEMP1Q12805 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
EFEMP1Q12805 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EFEMP1Q12805 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EFEMP1Q12805 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
EFEMP1Q12805 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
EFEMP1Q12805 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
EFEMP1Q12805 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EFEMP1Q12805 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
EFEMP1Q12805 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EFEMP1Q12805 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
EFEMP1Q12805 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
EFEMP1Q12805 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
EFEMP1Q12805 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
EFEMP1Q12805 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
EFEMP1Q12805 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
EFEMP1Q12805 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
EFEMP1Q12805 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
EFEMP1Q12805 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
EFEMP1Q12805 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
EFEMP1Q12805 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
EFEMP1Q12805 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
EFEMP1Q12805 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
EFEMP1Q12805 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
EFEMP1Q12805 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
EFEMP1Q12805 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
EFEMP1Q12805 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
EFEMP1Q12805 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
EFEMP1Q12805 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
EFEMP1Q12805 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
EFEMP1Q12805 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
EFEMP1Q12805 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
EFEMP1Q12805 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms