Protein–RNA interactions for Protein: Q10570

CPSF1, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPSF1Q10570 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CPSF1Q10570 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CPSF1Q10570 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CPSF1Q10570 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CPSF1Q10570 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CPSF1Q10570 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CPSF1Q10570 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CPSF1Q10570 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CPSF1Q10570 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CPSF1Q10570 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CPSF1Q10570 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CPSF1Q10570 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CPSF1Q10570 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CPSF1Q10570 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CPSF1Q10570 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CPSF1Q10570 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CPSF1Q10570 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CPSF1Q10570 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CPSF1Q10570 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CPSF1Q10570 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CPSF1Q10570 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CPSF1Q10570 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CPSF1Q10570 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CPSF1Q10570 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CPSF1Q10570 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CPSF1Q10570 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CPSF1Q10570 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CPSF1Q10570 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CPSF1Q10570 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CPSF1Q10570 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CPSF1Q10570 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CPSF1Q10570 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CPSF1Q10570 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CPSF1Q10570 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CPSF1Q10570 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CPSF1Q10570 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CPSF1Q10570 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CPSF1Q10570 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CPSF1Q10570 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CPSF1Q10570 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CPSF1Q10570 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CPSF1Q10570 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CPSF1Q10570 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CPSF1Q10570 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CPSF1Q10570 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CPSF1Q10570 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CPSF1Q10570 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CPSF1Q10570 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CPSF1Q10570 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CPSF1Q10570 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CPSF1Q10570 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CPSF1Q10570 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CPSF1Q10570 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CPSF1Q10570 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CPSF1Q10570 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CPSF1Q10570 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CPSF1Q10570 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CPSF1Q10570 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CPSF1Q10570 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CPSF1Q10570 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CPSF1Q10570 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CPSF1Q10570 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CPSF1Q10570 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CPSF1Q10570 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CPSF1Q10570 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CPSF1Q10570 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CPSF1Q10570 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CPSF1Q10570 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CPSF1Q10570 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CPSF1Q10570 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CPSF1Q10570 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CPSF1Q10570 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CPSF1Q10570 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CPSF1Q10570 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CPSF1Q10570 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CPSF1Q10570 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CPSF1Q10570 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CPSF1Q10570 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CPSF1Q10570 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CPSF1Q10570 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CPSF1Q10570 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CPSF1Q10570 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CPSF1Q10570 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CPSF1Q10570 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CPSF1Q10570 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CPSF1Q10570 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CPSF1Q10570 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CPSF1Q10570 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CPSF1Q10570 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CPSF1Q10570 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CPSF1Q10570 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CPSF1Q10570 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CPSF1Q10570 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CPSF1Q10570 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CPSF1Q10570 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CPSF1Q10570 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CPSF1Q10570 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CPSF1Q10570 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CPSF1Q10570 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
CPSF1Q10570 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
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