Protein–RNA interactions for Protein: Q08722

CD47, Leukocyte surface antigen CD47, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD47Q08722 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD47Q08722 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD47Q08722 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD47Q08722 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CD47Q08722 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD47Q08722 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CD47Q08722 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CD47Q08722 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD47Q08722 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD47Q08722 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD47Q08722 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD47Q08722 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD47Q08722 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD47Q08722 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD47Q08722 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD47Q08722 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD47Q08722 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CD47Q08722 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD47Q08722 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD47Q08722 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD47Q08722 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD47Q08722 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD47Q08722 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD47Q08722 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD47Q08722 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CD47Q08722 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CD47Q08722 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CD47Q08722 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CD47Q08722 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CD47Q08722 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CD47Q08722 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CD47Q08722 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CD47Q08722 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CD47Q08722 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CD47Q08722 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CD47Q08722 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CD47Q08722 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CD47Q08722 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CD47Q08722 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CD47Q08722 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CD47Q08722 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD47Q08722 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD47Q08722 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD47Q08722 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD47Q08722 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD47Q08722 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD47Q08722 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD47Q08722 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD47Q08722 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD47Q08722 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD47Q08722 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD47Q08722 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD47Q08722 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD47Q08722 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD47Q08722 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD47Q08722 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CD47Q08722 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD47Q08722 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD47Q08722 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD47Q08722 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CD47Q08722 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD47Q08722 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD47Q08722 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD47Q08722 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD47Q08722 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD47Q08722 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD47Q08722 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD47Q08722 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD47Q08722 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD47Q08722 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD47Q08722 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD47Q08722 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD47Q08722 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD47Q08722 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD47Q08722 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD47Q08722 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD47Q08722 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD47Q08722 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD47Q08722 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD47Q08722 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD47Q08722 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD47Q08722 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD47Q08722 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD47Q08722 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD47Q08722 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD47Q08722 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD47Q08722 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CD47Q08722 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD47Q08722 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD47Q08722 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD47Q08722 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CD47Q08722 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD47Q08722 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD47Q08722 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD47Q08722 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD47Q08722 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD47Q08722 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CD47Q08722 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CD47Q08722 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CD47Q08722 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms