Protein–RNA interactions for Protein: Q08188

TGM3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM3Q08188 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TGM3Q08188 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TGM3Q08188 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TGM3Q08188 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TGM3Q08188 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TGM3Q08188 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TGM3Q08188 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TGM3Q08188 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TGM3Q08188 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TGM3Q08188 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TGM3Q08188 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TGM3Q08188 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TGM3Q08188 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TGM3Q08188 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TGM3Q08188 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TGM3Q08188 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TGM3Q08188 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TGM3Q08188 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TGM3Q08188 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TGM3Q08188 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TGM3Q08188 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TGM3Q08188 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TGM3Q08188 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TGM3Q08188 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TGM3Q08188 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TGM3Q08188 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TGM3Q08188 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TGM3Q08188 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TGM3Q08188 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TGM3Q08188 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TGM3Q08188 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TGM3Q08188 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TGM3Q08188 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TGM3Q08188 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
TGM3Q08188 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TGM3Q08188 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TGM3Q08188 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TGM3Q08188 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TGM3Q08188 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TGM3Q08188 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TGM3Q08188 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
TGM3Q08188 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TGM3Q08188 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TGM3Q08188 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TGM3Q08188 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TGM3Q08188 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TGM3Q08188 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TGM3Q08188 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TGM3Q08188 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TGM3Q08188 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TGM3Q08188 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TGM3Q08188 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TGM3Q08188 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TGM3Q08188 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TGM3Q08188 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TGM3Q08188 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TGM3Q08188 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TGM3Q08188 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TGM3Q08188 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TGM3Q08188 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TGM3Q08188 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TGM3Q08188 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TGM3Q08188 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TGM3Q08188 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TGM3Q08188 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
TGM3Q08188 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TGM3Q08188 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TGM3Q08188 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TGM3Q08188 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TGM3Q08188 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TGM3Q08188 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TGM3Q08188 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TGM3Q08188 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TGM3Q08188 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TGM3Q08188 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TGM3Q08188 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TGM3Q08188 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TGM3Q08188 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TGM3Q08188 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TGM3Q08188 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TGM3Q08188 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TGM3Q08188 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TGM3Q08188 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TGM3Q08188 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TGM3Q08188 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TGM3Q08188 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TGM3Q08188 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TGM3Q08188 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TGM3Q08188 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TGM3Q08188 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TGM3Q08188 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TGM3Q08188 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TGM3Q08188 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TGM3Q08188 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TGM3Q08188 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TGM3Q08188 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TGM3Q08188 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TGM3Q08188 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TGM3Q08188 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TGM3Q08188 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms