Protein–RNA interactions for Protein: Q07065

CKAP4, Cytoskeleton-associated protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP4Q07065 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CKAP4Q07065 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CKAP4Q07065 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CKAP4Q07065 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CKAP4Q07065 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CKAP4Q07065 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CKAP4Q07065 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CKAP4Q07065 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CKAP4Q07065 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CKAP4Q07065 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CKAP4Q07065 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CKAP4Q07065 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CKAP4Q07065 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CKAP4Q07065 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CKAP4Q07065 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CKAP4Q07065 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CKAP4Q07065 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CKAP4Q07065 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CKAP4Q07065 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CKAP4Q07065 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CKAP4Q07065 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CKAP4Q07065 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CKAP4Q07065 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CKAP4Q07065 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CKAP4Q07065 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CKAP4Q07065 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CKAP4Q07065 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CKAP4Q07065 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CKAP4Q07065 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CKAP4Q07065 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CKAP4Q07065 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CKAP4Q07065 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CKAP4Q07065 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CKAP4Q07065 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CKAP4Q07065 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CKAP4Q07065 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CKAP4Q07065 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CKAP4Q07065 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CKAP4Q07065 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CKAP4Q07065 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CKAP4Q07065 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CKAP4Q07065 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CKAP4Q07065 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CKAP4Q07065 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CKAP4Q07065 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CKAP4Q07065 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CKAP4Q07065 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CKAP4Q07065 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CKAP4Q07065 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CKAP4Q07065 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CKAP4Q07065 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CKAP4Q07065 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CKAP4Q07065 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CKAP4Q07065 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CKAP4Q07065 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CKAP4Q07065 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CKAP4Q07065 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CKAP4Q07065 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CKAP4Q07065 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CKAP4Q07065 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CKAP4Q07065 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CKAP4Q07065 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CKAP4Q07065 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CKAP4Q07065 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CKAP4Q07065 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CKAP4Q07065 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CKAP4Q07065 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CKAP4Q07065 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CKAP4Q07065 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CKAP4Q07065 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CKAP4Q07065 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CKAP4Q07065 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CKAP4Q07065 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CKAP4Q07065 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CKAP4Q07065 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CKAP4Q07065 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CKAP4Q07065 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CKAP4Q07065 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CKAP4Q07065 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CKAP4Q07065 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CKAP4Q07065 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CKAP4Q07065 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CKAP4Q07065 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CKAP4Q07065 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CKAP4Q07065 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CKAP4Q07065 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CKAP4Q07065 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CKAP4Q07065 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CKAP4Q07065 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CKAP4Q07065 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CKAP4Q07065 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CKAP4Q07065 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CKAP4Q07065 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CKAP4Q07065 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CKAP4Q07065 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CKAP4Q07065 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CKAP4Q07065 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CKAP4Q07065 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CKAP4Q07065 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CKAP4Q07065 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms