Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
GABPAQ06546 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GABPAQ06546 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GABPAQ06546 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
GABPAQ06546 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GABPAQ06546 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GABPAQ06546 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GABPAQ06546 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GABPAQ06546 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GABPAQ06546 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GABPAQ06546 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GABPAQ06546 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GABPAQ06546 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GABPAQ06546 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GABPAQ06546 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GABPAQ06546 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GABPAQ06546 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GABPAQ06546 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GABPAQ06546 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GABPAQ06546 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GABPAQ06546 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GABPAQ06546 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GABPAQ06546 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GABPAQ06546 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GABPAQ06546 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GABPAQ06546 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
GABPAQ06546 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GABPAQ06546 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
GABPAQ06546 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GABPAQ06546 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GABPAQ06546 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GABPAQ06546 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
GABPAQ06546 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GABPAQ06546 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GABPAQ06546 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GABPAQ06546 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GABPAQ06546 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GABPAQ06546 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GABPAQ06546 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GABPAQ06546 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GABPAQ06546 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GABPAQ06546 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GABPAQ06546 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GABPAQ06546 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GABPAQ06546 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GABPAQ06546 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GABPAQ06546 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GABPAQ06546 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GABPAQ06546 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
GABPAQ06546 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GABPAQ06546 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GABPAQ06546 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GABPAQ06546 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
GABPAQ06546 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GABPAQ06546 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GABPAQ06546 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GABPAQ06546 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GABPAQ06546 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GABPAQ06546 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GABPAQ06546 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GABPAQ06546 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
GABPAQ06546 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GABPAQ06546 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GABPAQ06546 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GABPAQ06546 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GABPAQ06546 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GABPAQ06546 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GABPAQ06546 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GABPAQ06546 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GABPAQ06546 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GABPAQ06546 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
GABPAQ06546 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GABPAQ06546 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GABPAQ06546 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GABPAQ06546 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GABPAQ06546 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GABPAQ06546 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
GABPAQ06546 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GABPAQ06546 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GABPAQ06546 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GABPAQ06546 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GABPAQ06546 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GABPAQ06546 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
GABPAQ06546 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GABPAQ06546 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
GABPAQ06546 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
GABPAQ06546 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GABPAQ06546 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GABPAQ06546 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GABPAQ06546 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GABPAQ06546 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GABPAQ06546 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GABPAQ06546 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GABPAQ06546 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
GABPAQ06546 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GABPAQ06546 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GABPAQ06546 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GABPAQ06546 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GABPAQ06546 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
GABPAQ06546 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms