Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DEUP1Q05D60 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DEUP1Q05D60 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DEUP1Q05D60 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DEUP1Q05D60 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DEUP1Q05D60 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DEUP1Q05D60 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
DEUP1Q05D60 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DEUP1Q05D60 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DEUP1Q05D60 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DEUP1Q05D60 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DEUP1Q05D60 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DEUP1Q05D60 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DEUP1Q05D60 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DEUP1Q05D60 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DEUP1Q05D60 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DEUP1Q05D60 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DEUP1Q05D60 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DEUP1Q05D60 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DEUP1Q05D60 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DEUP1Q05D60 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DEUP1Q05D60 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DEUP1Q05D60 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DEUP1Q05D60 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DEUP1Q05D60 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DEUP1Q05D60 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
DEUP1Q05D60 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
DEUP1Q05D60 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DEUP1Q05D60 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DEUP1Q05D60 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DEUP1Q05D60 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DEUP1Q05D60 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DEUP1Q05D60 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DEUP1Q05D60 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DEUP1Q05D60 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DEUP1Q05D60 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DEUP1Q05D60 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DEUP1Q05D60 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DEUP1Q05D60 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DEUP1Q05D60 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DEUP1Q05D60 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DEUP1Q05D60 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DEUP1Q05D60 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DEUP1Q05D60 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DEUP1Q05D60 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DEUP1Q05D60 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DEUP1Q05D60 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DEUP1Q05D60 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DEUP1Q05D60 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DEUP1Q05D60 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
DEUP1Q05D60 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DEUP1Q05D60 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DEUP1Q05D60 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DEUP1Q05D60 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DEUP1Q05D60 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DEUP1Q05D60 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
DEUP1Q05D60 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
DEUP1Q05D60 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
DEUP1Q05D60 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
DEUP1Q05D60 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
DEUP1Q05D60 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
DEUP1Q05D60 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
DEUP1Q05D60 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
DEUP1Q05D60 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DEUP1Q05D60 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DEUP1Q05D60 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DEUP1Q05D60 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DEUP1Q05D60 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DEUP1Q05D60 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DEUP1Q05D60 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DEUP1Q05D60 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DEUP1Q05D60 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DEUP1Q05D60 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DEUP1Q05D60 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DEUP1Q05D60 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DEUP1Q05D60 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DEUP1Q05D60 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DEUP1Q05D60 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DEUP1Q05D60 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DEUP1Q05D60 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DEUP1Q05D60 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DEUP1Q05D60 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
DEUP1Q05D60 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DEUP1Q05D60 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DEUP1Q05D60 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DEUP1Q05D60 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DEUP1Q05D60 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DEUP1Q05D60 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DEUP1Q05D60 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DEUP1Q05D60 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DEUP1Q05D60 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DEUP1Q05D60 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DEUP1Q05D60 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DEUP1Q05D60 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DEUP1Q05D60 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DEUP1Q05D60 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DEUP1Q05D60 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DEUP1Q05D60 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DEUP1Q05D60 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DEUP1Q05D60 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms