Protein–RNA interactions for Protein: Q04900

CD164, Sialomucin core protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD164Q04900 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
CD164Q04900 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
CD164Q04900 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
CD164Q04900 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
CD164Q04900 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
CD164Q04900 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
CD164Q04900 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
CD164Q04900 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
CD164Q04900 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
CD164Q04900 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
CD164Q04900 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
CD164Q04900 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
CD164Q04900 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
CD164Q04900 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
CD164Q04900 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
CD164Q04900 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
CD164Q04900 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
CD164Q04900 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
CD164Q04900 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
CD164Q04900 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
CD164Q04900 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
CD164Q04900 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
CD164Q04900 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
CD164Q04900 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC11.4□□□□□ -0.58
CD164Q04900 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
CD164Q04900 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
CD164Q04900 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
CD164Q04900 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
CD164Q04900 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
CD164Q04900 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
CD164Q04900 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
CD164Q04900 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
CD164Q04900 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
CD164Q04900 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
CD164Q04900 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
CD164Q04900 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
CD164Q04900 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
CD164Q04900 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
CD164Q04900 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
CD164Q04900 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.59
CD164Q04900 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
CD164Q04900 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
CD164Q04900 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
CD164Q04900 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CD164Q04900 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CD164Q04900 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
CD164Q04900 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
CD164Q04900 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
CD164Q04900 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
CD164Q04900 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CD164Q04900 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CD164Q04900 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CD164Q04900 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
CD164Q04900 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CD164Q04900 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CD164Q04900 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CD164Q04900 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CD164Q04900 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
CD164Q04900 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
CD164Q04900 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CD164Q04900 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CD164Q04900 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
CD164Q04900 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
CD164Q04900 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
CD164Q04900 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
CD164Q04900 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CD164Q04900 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
CD164Q04900 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CD164Q04900 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
CD164Q04900 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
CD164Q04900 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
CD164Q04900 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
CD164Q04900 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC11.39□□□□□ -0.59
CD164Q04900 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
CD164Q04900 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
CD164Q04900 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
CD164Q04900 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
CD164Q04900 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CD164Q04900 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
CD164Q04900 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CD164Q04900 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
CD164Q04900 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
CD164Q04900 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
CD164Q04900 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CD164Q04900 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CD164Q04900 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CD164Q04900 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
CD164Q04900 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CD164Q04900 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
CD164Q04900 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
CD164Q04900 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CD164Q04900 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CD164Q04900 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
CD164Q04900 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CD164Q04900 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
CD164Q04900 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CD164Q04900 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
CD164Q04900 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
CD164Q04900 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
CD164Q04900 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms