Protein–RNA interactions for Protein: Q04118

PRB3, Basic salivary proline-rich protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRB3Q04118 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRB3Q04118 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRB3Q04118 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PRB3Q04118 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PRB3Q04118 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PRB3Q04118 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRB3Q04118 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRB3Q04118 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRB3Q04118 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRB3Q04118 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRB3Q04118 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRB3Q04118 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PRB3Q04118 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRB3Q04118 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRB3Q04118 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRB3Q04118 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRB3Q04118 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRB3Q04118 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRB3Q04118 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRB3Q04118 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRB3Q04118 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRB3Q04118 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRB3Q04118 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRB3Q04118 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRB3Q04118 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRB3Q04118 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRB3Q04118 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PRB3Q04118 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRB3Q04118 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PRB3Q04118 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRB3Q04118 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRB3Q04118 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRB3Q04118 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRB3Q04118 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRB3Q04118 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRB3Q04118 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PRB3Q04118 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRB3Q04118 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRB3Q04118 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRB3Q04118 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRB3Q04118 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRB3Q04118 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRB3Q04118 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRB3Q04118 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRB3Q04118 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRB3Q04118 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRB3Q04118 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRB3Q04118 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRB3Q04118 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRB3Q04118 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRB3Q04118 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRB3Q04118 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PRB3Q04118 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRB3Q04118 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRB3Q04118 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRB3Q04118 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRB3Q04118 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PRB3Q04118 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRB3Q04118 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRB3Q04118 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRB3Q04118 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PRB3Q04118 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PRB3Q04118 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRB3Q04118 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRB3Q04118 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRB3Q04118 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRB3Q04118 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRB3Q04118 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PRB3Q04118 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRB3Q04118 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRB3Q04118 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRB3Q04118 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRB3Q04118 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRB3Q04118 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRB3Q04118 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRB3Q04118 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRB3Q04118 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRB3Q04118 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRB3Q04118 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRB3Q04118 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRB3Q04118 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRB3Q04118 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRB3Q04118 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PRB3Q04118 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRB3Q04118 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRB3Q04118 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PRB3Q04118 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRB3Q04118 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRB3Q04118 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRB3Q04118 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRB3Q04118 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PRB3Q04118 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PRB3Q04118 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PRB3Q04118 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PRB3Q04118 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PRB3Q04118 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PRB3Q04118 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRB3Q04118 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRB3Q04118 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRB3Q04118 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms