Protein–RNA interactions for Protein: Q02880

TOP2B, DNA topoisomerase 2-beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2BQ02880 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
TOP2BQ02880 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
TOP2BQ02880 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
TOP2BQ02880 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
TOP2BQ02880 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
TOP2BQ02880 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
TOP2BQ02880 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
TOP2BQ02880 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
TOP2BQ02880 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
TOP2BQ02880 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
TOP2BQ02880 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC32.04■■■□□ 2.72
TOP2BQ02880 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
TOP2BQ02880 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
TOP2BQ02880 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
TOP2BQ02880 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
TOP2BQ02880 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
TOP2BQ02880 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
TOP2BQ02880 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
TOP2BQ02880 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
TOP2BQ02880 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
TOP2BQ02880 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
TOP2BQ02880 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
TOP2BQ02880 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
TOP2BQ02880 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
TOP2BQ02880 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
TOP2BQ02880 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
TOP2BQ02880 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
TOP2BQ02880 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
TOP2BQ02880 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
TOP2BQ02880 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
TOP2BQ02880 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC32.03■■■□□ 2.72
TOP2BQ02880 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
TOP2BQ02880 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
TOP2BQ02880 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
TOP2BQ02880 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
TOP2BQ02880 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
TOP2BQ02880 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
TOP2BQ02880 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
TOP2BQ02880 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
TOP2BQ02880 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
TOP2BQ02880 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC32.03■■■□□ 2.72
TOP2BQ02880 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
TOP2BQ02880 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
TOP2BQ02880 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
TOP2BQ02880 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
TOP2BQ02880 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
TOP2BQ02880 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
TOP2BQ02880 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
TOP2BQ02880 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
TOP2BQ02880 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
TOP2BQ02880 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
TOP2BQ02880 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
TOP2BQ02880 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
TOP2BQ02880 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
TOP2BQ02880 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
TOP2BQ02880 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
TOP2BQ02880 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
TOP2BQ02880 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
TOP2BQ02880 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
TOP2BQ02880 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
TOP2BQ02880 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.72
TOP2BQ02880 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.72
TOP2BQ02880 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.72
TOP2BQ02880 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.72
TOP2BQ02880 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC32.01■■■□□ 2.72
TOP2BQ02880 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
TOP2BQ02880 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC32.01■■■□□ 2.72
TOP2BQ02880 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
TOP2BQ02880 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
TOP2BQ02880 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC32.01■■■□□ 2.71
TOP2BQ02880 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
TOP2BQ02880 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
TOP2BQ02880 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
TOP2BQ02880 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
TOP2BQ02880 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
TOP2BQ02880 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
TOP2BQ02880 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC32■■■□□ 2.71
TOP2BQ02880 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
TOP2BQ02880 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
TOP2BQ02880 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
TOP2BQ02880 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
TOP2BQ02880 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
TOP2BQ02880 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
TOP2BQ02880 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32■■■□□ 2.71
TOP2BQ02880 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
TOP2BQ02880 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
TOP2BQ02880 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
TOP2BQ02880 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
TOP2BQ02880 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
TOP2BQ02880 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
TOP2BQ02880 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
TOP2BQ02880 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
TOP2BQ02880 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
TOP2BQ02880 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
TOP2BQ02880 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
TOP2BQ02880 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
TOP2BQ02880 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
TOP2BQ02880 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
TOP2BQ02880 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
TOP2BQ02880 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms