Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IFITM3Q01628 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IFITM3Q01628 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IFITM3Q01628 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IFITM3Q01628 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IFITM3Q01628 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IFITM3Q01628 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IFITM3Q01628 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IFITM3Q01628 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IFITM3Q01628 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IFITM3Q01628 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IFITM3Q01628 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IFITM3Q01628 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IFITM3Q01628 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IFITM3Q01628 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IFITM3Q01628 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
IFITM3Q01628 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IFITM3Q01628 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IFITM3Q01628 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IFITM3Q01628 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IFITM3Q01628 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IFITM3Q01628 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IFITM3Q01628 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IFITM3Q01628 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IFITM3Q01628 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IFITM3Q01628 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IFITM3Q01628 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IFITM3Q01628 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IFITM3Q01628 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IFITM3Q01628 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IFITM3Q01628 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IFITM3Q01628 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IFITM3Q01628 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IFITM3Q01628 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IFITM3Q01628 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IFITM3Q01628 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
IFITM3Q01628 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IFITM3Q01628 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IFITM3Q01628 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IFITM3Q01628 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IFITM3Q01628 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IFITM3Q01628 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IFITM3Q01628 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IFITM3Q01628 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IFITM3Q01628 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IFITM3Q01628 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IFITM3Q01628 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IFITM3Q01628 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IFITM3Q01628 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IFITM3Q01628 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IFITM3Q01628 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IFITM3Q01628 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IFITM3Q01628 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IFITM3Q01628 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IFITM3Q01628 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IFITM3Q01628 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IFITM3Q01628 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IFITM3Q01628 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IFITM3Q01628 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IFITM3Q01628 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IFITM3Q01628 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IFITM3Q01628 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IFITM3Q01628 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IFITM3Q01628 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IFITM3Q01628 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
IFITM3Q01628 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IFITM3Q01628 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IFITM3Q01628 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IFITM3Q01628 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IFITM3Q01628 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IFITM3Q01628 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IFITM3Q01628 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IFITM3Q01628 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
IFITM3Q01628 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
IFITM3Q01628 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IFITM3Q01628 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
IFITM3Q01628 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
IFITM3Q01628 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IFITM3Q01628 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
IFITM3Q01628 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
IFITM3Q01628 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
IFITM3Q01628 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
IFITM3Q01628 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
IFITM3Q01628 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IFITM3Q01628 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IFITM3Q01628 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IFITM3Q01628 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IFITM3Q01628 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
IFITM3Q01628 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
IFITM3Q01628 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
IFITM3Q01628 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
IFITM3Q01628 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
IFITM3Q01628 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IFITM3Q01628 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
IFITM3Q01628 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IFITM3Q01628 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IFITM3Q01628 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IFITM3Q01628 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
IFITM3Q01628 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
IFITM3Q01628 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms