Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TMF1P82094 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TMF1P82094 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TMF1P82094 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
TMF1P82094 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TMF1P82094 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
TMF1P82094 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TMF1P82094 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
TMF1P82094 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TMF1P82094 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
TMF1P82094 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TMF1P82094 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TMF1P82094 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TMF1P82094 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
TMF1P82094 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TMF1P82094 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TMF1P82094 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TMF1P82094 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TMF1P82094 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TMF1P82094 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
TMF1P82094 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
TMF1P82094 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TMF1P82094 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TMF1P82094 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TMF1P82094 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TMF1P82094 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TMF1P82094 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TMF1P82094 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TMF1P82094 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TMF1P82094 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TMF1P82094 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TMF1P82094 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TMF1P82094 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TMF1P82094 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TMF1P82094 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TMF1P82094 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
TMF1P82094 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TMF1P82094 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
TMF1P82094 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
TMF1P82094 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
TMF1P82094 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TMF1P82094 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TMF1P82094 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TMF1P82094 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TMF1P82094 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TMF1P82094 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TMF1P82094 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TMF1P82094 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TMF1P82094 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TMF1P82094 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TMF1P82094 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
TMF1P82094 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TMF1P82094 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
TMF1P82094 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TMF1P82094 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TMF1P82094 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TMF1P82094 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
TMF1P82094 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
TMF1P82094 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
TMF1P82094 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TMF1P82094 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TMF1P82094 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TMF1P82094 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TMF1P82094 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TMF1P82094 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TMF1P82094 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TMF1P82094 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TMF1P82094 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TMF1P82094 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
TMF1P82094 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
TMF1P82094 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TMF1P82094 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
TMF1P82094 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
TMF1P82094 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TMF1P82094 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TMF1P82094 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TMF1P82094 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TMF1P82094 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TMF1P82094 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TMF1P82094 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TMF1P82094 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TMF1P82094 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TMF1P82094 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TMF1P82094 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
TMF1P82094 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TMF1P82094 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TMF1P82094 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TMF1P82094 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TMF1P82094 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TMF1P82094 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TMF1P82094 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TMF1P82094 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TMF1P82094 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TMF1P82094 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TMF1P82094 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TMF1P82094 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TMF1P82094 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TMF1P82094 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TMF1P82094 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TMF1P82094 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms