Protein–RNA interactions for Protein: P63208

SKP1, S-phase kinase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP1P63208 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SKP1P63208 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SKP1P63208 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SKP1P63208 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SKP1P63208 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SKP1P63208 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SKP1P63208 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SKP1P63208 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SKP1P63208 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SKP1P63208 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SKP1P63208 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SKP1P63208 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SKP1P63208 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SKP1P63208 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SKP1P63208 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SKP1P63208 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SKP1P63208 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SKP1P63208 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SKP1P63208 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SKP1P63208 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SKP1P63208 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SKP1P63208 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SKP1P63208 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SKP1P63208 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SKP1P63208 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SKP1P63208 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SKP1P63208 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SKP1P63208 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SKP1P63208 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SKP1P63208 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SKP1P63208 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SKP1P63208 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SKP1P63208 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SKP1P63208 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SKP1P63208 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SKP1P63208 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SKP1P63208 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SKP1P63208 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SKP1P63208 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SKP1P63208 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SKP1P63208 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SKP1P63208 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SKP1P63208 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SKP1P63208 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SKP1P63208 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SKP1P63208 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SKP1P63208 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SKP1P63208 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SKP1P63208 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SKP1P63208 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SKP1P63208 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SKP1P63208 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SKP1P63208 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SKP1P63208 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SKP1P63208 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SKP1P63208 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SKP1P63208 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SKP1P63208 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SKP1P63208 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SKP1P63208 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SKP1P63208 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SKP1P63208 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SKP1P63208 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SKP1P63208 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SKP1P63208 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SKP1P63208 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SKP1P63208 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SKP1P63208 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SKP1P63208 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SKP1P63208 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SKP1P63208 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SKP1P63208 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SKP1P63208 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SKP1P63208 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SKP1P63208 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SKP1P63208 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SKP1P63208 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SKP1P63208 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SKP1P63208 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SKP1P63208 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SKP1P63208 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SKP1P63208 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SKP1P63208 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SKP1P63208 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SKP1P63208 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SKP1P63208 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SKP1P63208 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SKP1P63208 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SKP1P63208 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SKP1P63208 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SKP1P63208 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SKP1P63208 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SKP1P63208 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SKP1P63208 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SKP1P63208 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SKP1P63208 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SKP1P63208 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SKP1P63208 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SKP1P63208 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SKP1P63208 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms