Protein–RNA interactions for Protein: P62857

RPS28, 40S ribosomal protein S28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 69 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS28P62857 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
RPS28P62857 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
RPS28P62857 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
RPS28P62857 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
RPS28P62857 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
RPS28P62857 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
RPS28P62857 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
RPS28P62857 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
RPS28P62857 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
RPS28P62857 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
RPS28P62857 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
RPS28P62857 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
RPS28P62857 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
RPS28P62857 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
RPS28P62857 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
RPS28P62857 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
RPS28P62857 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
RPS28P62857 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
RPS28P62857 FUBP1-203ENST00000370768 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
RPS28P62857 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
RPS28P62857 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
RPS28P62857 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
RPS28P62857 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
RPS28P62857 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
RPS28P62857 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
RPS28P62857 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
RPS28P62857 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
RPS28P62857 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
RPS28P62857 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
RPS28P62857 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
RPS28P62857 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
RPS28P62857 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.63
RPS28P62857 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
RPS28P62857 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
RPS28P62857 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC11.15□□□□□ -0.63
RPS28P62857 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
RPS28P62857 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RPS28P62857 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RPS28P62857 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RPS28P62857 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RPS28P62857 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RPS28P62857 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RPS28P62857 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RPS28P62857 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RPS28P62857 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RPS28P62857 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RPS28P62857 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RPS28P62857 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RPS28P62857 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RPS28P62857 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RPS28P62857 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
RPS28P62857 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RPS28P62857 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RPS28P62857 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RPS28P62857 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RPS28P62857 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RPS28P62857 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RPS28P62857 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RPS28P62857 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RPS28P62857 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RPS28P62857 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RPS28P62857 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RPS28P62857 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RPS28P62857 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RPS28P62857 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RPS28P62857 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RPS28P62857 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RPS28P62857 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RPS28P62857 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RPS28P62857 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RPS28P62857 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RPS28P62857 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RPS28P62857 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RPS28P62857 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RPS28P62857 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RPS28P62857 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RPS28P62857 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RPS28P62857 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
RPS28P62857 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RPS28P62857 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RPS28P62857 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RPS28P62857 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RPS28P62857 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RPS28P62857 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RPS28P62857 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RPS28P62857 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RPS28P62857 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RPS28P62857 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RPS28P62857 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RPS28P62857 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RPS28P62857 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RPS28P62857 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RPS28P62857 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RPS28P62857 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RPS28P62857 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RPS28P62857 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RPS28P62857 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RPS28P62857 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RPS28P62857 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RPS28P62857 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms