Protein–RNA interactions for Protein: P60880

SNAP25, Synaptosomal-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP25P60880 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SNAP25P60880 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNAP25P60880 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SNAP25P60880 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SNAP25P60880 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNAP25P60880 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNAP25P60880 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNAP25P60880 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNAP25P60880 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNAP25P60880 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNAP25P60880 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNAP25P60880 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNAP25P60880 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNAP25P60880 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNAP25P60880 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNAP25P60880 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNAP25P60880 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNAP25P60880 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SNAP25P60880 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNAP25P60880 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNAP25P60880 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNAP25P60880 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNAP25P60880 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNAP25P60880 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNAP25P60880 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SNAP25P60880 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNAP25P60880 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNAP25P60880 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNAP25P60880 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNAP25P60880 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNAP25P60880 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNAP25P60880 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNAP25P60880 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNAP25P60880 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNAP25P60880 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNAP25P60880 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNAP25P60880 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNAP25P60880 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNAP25P60880 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNAP25P60880 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SNAP25P60880 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SNAP25P60880 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNAP25P60880 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNAP25P60880 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNAP25P60880 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNAP25P60880 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNAP25P60880 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNAP25P60880 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNAP25P60880 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNAP25P60880 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNAP25P60880 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNAP25P60880 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNAP25P60880 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNAP25P60880 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNAP25P60880 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SNAP25P60880 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNAP25P60880 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNAP25P60880 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNAP25P60880 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SNAP25P60880 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SNAP25P60880 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SNAP25P60880 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SNAP25P60880 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SNAP25P60880 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SNAP25P60880 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SNAP25P60880 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SNAP25P60880 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNAP25P60880 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNAP25P60880 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNAP25P60880 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNAP25P60880 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNAP25P60880 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNAP25P60880 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNAP25P60880 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNAP25P60880 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNAP25P60880 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNAP25P60880 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNAP25P60880 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNAP25P60880 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SNAP25P60880 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNAP25P60880 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNAP25P60880 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNAP25P60880 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNAP25P60880 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNAP25P60880 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNAP25P60880 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNAP25P60880 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNAP25P60880 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNAP25P60880 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNAP25P60880 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNAP25P60880 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNAP25P60880 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SNAP25P60880 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNAP25P60880 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNAP25P60880 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNAP25P60880 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNAP25P60880 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNAP25P60880 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNAP25P60880 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNAP25P60880 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms