Protein–RNA interactions for Protein: P57078

RIPK4, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPK4P57078 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RIPK4P57078 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RIPK4P57078 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RIPK4P57078 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RIPK4P57078 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RIPK4P57078 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RIPK4P57078 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RIPK4P57078 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RIPK4P57078 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RIPK4P57078 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RIPK4P57078 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RIPK4P57078 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RIPK4P57078 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RIPK4P57078 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RIPK4P57078 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RIPK4P57078 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RIPK4P57078 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
RIPK4P57078 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
RIPK4P57078 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
RIPK4P57078 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RIPK4P57078 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RIPK4P57078 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RIPK4P57078 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RIPK4P57078 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RIPK4P57078 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RIPK4P57078 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RIPK4P57078 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RIPK4P57078 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RIPK4P57078 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RIPK4P57078 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RIPK4P57078 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RIPK4P57078 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RIPK4P57078 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RIPK4P57078 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RIPK4P57078 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RIPK4P57078 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RIPK4P57078 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RIPK4P57078 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
RIPK4P57078 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RIPK4P57078 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RIPK4P57078 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
RIPK4P57078 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RIPK4P57078 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RIPK4P57078 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RIPK4P57078 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RIPK4P57078 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RIPK4P57078 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
RIPK4P57078 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RIPK4P57078 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
RIPK4P57078 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RIPK4P57078 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RIPK4P57078 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RIPK4P57078 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
RIPK4P57078 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RIPK4P57078 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RIPK4P57078 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RIPK4P57078 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RIPK4P57078 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RIPK4P57078 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RIPK4P57078 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RIPK4P57078 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RIPK4P57078 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RIPK4P57078 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RIPK4P57078 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RIPK4P57078 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
RIPK4P57078 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RIPK4P57078 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RIPK4P57078 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RIPK4P57078 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RIPK4P57078 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RIPK4P57078 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RIPK4P57078 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
RIPK4P57078 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RIPK4P57078 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RIPK4P57078 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RIPK4P57078 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RIPK4P57078 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RIPK4P57078 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RIPK4P57078 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RIPK4P57078 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RIPK4P57078 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RIPK4P57078 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RIPK4P57078 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RIPK4P57078 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RIPK4P57078 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RIPK4P57078 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RIPK4P57078 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RIPK4P57078 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RIPK4P57078 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RIPK4P57078 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RIPK4P57078 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
RIPK4P57078 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RIPK4P57078 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RIPK4P57078 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RIPK4P57078 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RIPK4P57078 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RIPK4P57078 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RIPK4P57078 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RIPK4P57078 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RIPK4P57078 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms