Protein–RNA interactions for Protein: P57059

SIK1, Serine/threonine-protein kinase SIK1, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIK1P57059 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SIK1P57059 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SIK1P57059 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SIK1P57059 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SIK1P57059 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SIK1P57059 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SIK1P57059 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SIK1P57059 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SIK1P57059 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
SIK1P57059 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SIK1P57059 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SIK1P57059 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SIK1P57059 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SIK1P57059 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SIK1P57059 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SIK1P57059 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SIK1P57059 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SIK1P57059 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SIK1P57059 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SIK1P57059 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SIK1P57059 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SIK1P57059 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SIK1P57059 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SIK1P57059 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SIK1P57059 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SIK1P57059 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SIK1P57059 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SIK1P57059 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SIK1P57059 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SIK1P57059 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SIK1P57059 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SIK1P57059 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SIK1P57059 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SIK1P57059 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SIK1P57059 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SIK1P57059 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SIK1P57059 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SIK1P57059 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SIK1P57059 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SIK1P57059 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SIK1P57059 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SIK1P57059 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SIK1P57059 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SIK1P57059 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SIK1P57059 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SIK1P57059 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SIK1P57059 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SIK1P57059 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SIK1P57059 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SIK1P57059 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SIK1P57059 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SIK1P57059 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SIK1P57059 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SIK1P57059 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SIK1P57059 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SIK1P57059 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SIK1P57059 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SIK1P57059 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SIK1P57059 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SIK1P57059 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SIK1P57059 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SIK1P57059 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SIK1P57059 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SIK1P57059 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SIK1P57059 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SIK1P57059 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SIK1P57059 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SIK1P57059 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SIK1P57059 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SIK1P57059 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SIK1P57059 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SIK1P57059 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SIK1P57059 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SIK1P57059 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SIK1P57059 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SIK1P57059 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SIK1P57059 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SIK1P57059 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SIK1P57059 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SIK1P57059 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SIK1P57059 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SIK1P57059 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SIK1P57059 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SIK1P57059 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SIK1P57059 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SIK1P57059 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SIK1P57059 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SIK1P57059 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SIK1P57059 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SIK1P57059 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SIK1P57059 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SIK1P57059 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SIK1P57059 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SIK1P57059 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SIK1P57059 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SIK1P57059 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SIK1P57059 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SIK1P57059 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SIK1P57059 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SIK1P57059 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms