Protein–RNA interactions for Protein: P56817

BACE1, Beta-secretase 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BACE1P56817 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BACE1P56817 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BACE1P56817 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BACE1P56817 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BACE1P56817 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
BACE1P56817 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
BACE1P56817 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BACE1P56817 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BACE1P56817 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BACE1P56817 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BACE1P56817 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BACE1P56817 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BACE1P56817 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BACE1P56817 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BACE1P56817 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BACE1P56817 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BACE1P56817 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BACE1P56817 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BACE1P56817 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BACE1P56817 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BACE1P56817 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BACE1P56817 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BACE1P56817 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BACE1P56817 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BACE1P56817 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BACE1P56817 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BACE1P56817 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BACE1P56817 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BACE1P56817 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BACE1P56817 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BACE1P56817 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BACE1P56817 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BACE1P56817 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BACE1P56817 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
BACE1P56817 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BACE1P56817 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
BACE1P56817 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BACE1P56817 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BACE1P56817 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BACE1P56817 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BACE1P56817 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BACE1P56817 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BACE1P56817 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
BACE1P56817 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BACE1P56817 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BACE1P56817 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BACE1P56817 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BACE1P56817 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BACE1P56817 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
BACE1P56817 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BACE1P56817 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BACE1P56817 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BACE1P56817 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BACE1P56817 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BACE1P56817 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BACE1P56817 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BACE1P56817 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BACE1P56817 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BACE1P56817 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BACE1P56817 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BACE1P56817 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BACE1P56817 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BACE1P56817 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BACE1P56817 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BACE1P56817 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BACE1P56817 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BACE1P56817 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BACE1P56817 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
BACE1P56817 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BACE1P56817 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BACE1P56817 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BACE1P56817 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BACE1P56817 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BACE1P56817 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BACE1P56817 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BACE1P56817 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BACE1P56817 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BACE1P56817 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BACE1P56817 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BACE1P56817 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BACE1P56817 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BACE1P56817 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
BACE1P56817 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BACE1P56817 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BACE1P56817 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BACE1P56817 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BACE1P56817 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
BACE1P56817 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BACE1P56817 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BACE1P56817 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BACE1P56817 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BACE1P56817 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BACE1P56817 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BACE1P56817 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BACE1P56817 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BACE1P56817 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BACE1P56817 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BACE1P56817 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BACE1P56817 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BACE1P56817 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.3 ms