Protein–RNA interactions for Protein: P56696

KCNQ4, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 4, humanhuman

Predictions only

Length 695 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ4P56696 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNQ4P56696 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNQ4P56696 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNQ4P56696 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNQ4P56696 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNQ4P56696 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNQ4P56696 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNQ4P56696 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNQ4P56696 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNQ4P56696 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNQ4P56696 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNQ4P56696 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNQ4P56696 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNQ4P56696 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNQ4P56696 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNQ4P56696 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNQ4P56696 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNQ4P56696 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNQ4P56696 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNQ4P56696 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNQ4P56696 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNQ4P56696 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNQ4P56696 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNQ4P56696 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNQ4P56696 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNQ4P56696 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNQ4P56696 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNQ4P56696 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNQ4P56696 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNQ4P56696 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNQ4P56696 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNQ4P56696 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNQ4P56696 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNQ4P56696 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNQ4P56696 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNQ4P56696 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNQ4P56696 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNQ4P56696 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNQ4P56696 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCNQ4P56696 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCNQ4P56696 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCNQ4P56696 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
KCNQ4P56696 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
KCNQ4P56696 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCNQ4P56696 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCNQ4P56696 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCNQ4P56696 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
KCNQ4P56696 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
KCNQ4P56696 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCNQ4P56696 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNQ4P56696 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNQ4P56696 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNQ4P56696 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNQ4P56696 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNQ4P56696 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNQ4P56696 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNQ4P56696 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNQ4P56696 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNQ4P56696 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNQ4P56696 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNQ4P56696 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNQ4P56696 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNQ4P56696 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNQ4P56696 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNQ4P56696 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNQ4P56696 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNQ4P56696 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNQ4P56696 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNQ4P56696 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNQ4P56696 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNQ4P56696 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNQ4P56696 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNQ4P56696 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNQ4P56696 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNQ4P56696 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNQ4P56696 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNQ4P56696 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNQ4P56696 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNQ4P56696 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNQ4P56696 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNQ4P56696 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNQ4P56696 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNQ4P56696 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNQ4P56696 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNQ4P56696 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNQ4P56696 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNQ4P56696 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNQ4P56696 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNQ4P56696 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNQ4P56696 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
KCNQ4P56696 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
KCNQ4P56696 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
KCNQ4P56696 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KCNQ4P56696 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KCNQ4P56696 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KCNQ4P56696 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KCNQ4P56696 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KCNQ4P56696 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KCNQ4P56696 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KCNQ4P56696 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms