Protein–RNA interactions for Protein: P54920

NAPA, Alpha-soluble NSF attachment protein, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAPAP54920 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NAPAP54920 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NAPAP54920 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NAPAP54920 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NAPAP54920 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NAPAP54920 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NAPAP54920 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NAPAP54920 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NAPAP54920 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NAPAP54920 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NAPAP54920 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NAPAP54920 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NAPAP54920 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NAPAP54920 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NAPAP54920 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NAPAP54920 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NAPAP54920 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NAPAP54920 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NAPAP54920 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NAPAP54920 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NAPAP54920 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NAPAP54920 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NAPAP54920 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NAPAP54920 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NAPAP54920 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NAPAP54920 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NAPAP54920 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NAPAP54920 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NAPAP54920 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NAPAP54920 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NAPAP54920 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NAPAP54920 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NAPAP54920 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NAPAP54920 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NAPAP54920 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NAPAP54920 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NAPAP54920 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NAPAP54920 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NAPAP54920 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NAPAP54920 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NAPAP54920 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NAPAP54920 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NAPAP54920 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NAPAP54920 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NAPAP54920 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NAPAP54920 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NAPAP54920 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NAPAP54920 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NAPAP54920 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NAPAP54920 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NAPAP54920 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NAPAP54920 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NAPAP54920 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NAPAP54920 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NAPAP54920 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NAPAP54920 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NAPAP54920 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NAPAP54920 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NAPAP54920 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NAPAP54920 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NAPAP54920 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NAPAP54920 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NAPAP54920 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NAPAP54920 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NAPAP54920 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NAPAP54920 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NAPAP54920 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NAPAP54920 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NAPAP54920 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NAPAP54920 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NAPAP54920 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NAPAP54920 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NAPAP54920 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NAPAP54920 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NAPAP54920 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NAPAP54920 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NAPAP54920 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NAPAP54920 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NAPAP54920 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NAPAP54920 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NAPAP54920 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NAPAP54920 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NAPAP54920 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NAPAP54920 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NAPAP54920 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NAPAP54920 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NAPAP54920 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NAPAP54920 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NAPAP54920 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NAPAP54920 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NAPAP54920 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NAPAP54920 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NAPAP54920 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NAPAP54920 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NAPAP54920 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NAPAP54920 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NAPAP54920 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NAPAP54920 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NAPAP54920 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NAPAP54920 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms