Protein–RNA interactions for Protein: P54727

RAD23B, UV excision repair protein RAD23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23BP54727 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAD23BP54727 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAD23BP54727 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAD23BP54727 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAD23BP54727 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAD23BP54727 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAD23BP54727 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAD23BP54727 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAD23BP54727 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAD23BP54727 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAD23BP54727 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAD23BP54727 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAD23BP54727 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAD23BP54727 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAD23BP54727 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAD23BP54727 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAD23BP54727 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAD23BP54727 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAD23BP54727 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAD23BP54727 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAD23BP54727 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
RAD23BP54727 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAD23BP54727 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAD23BP54727 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAD23BP54727 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAD23BP54727 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAD23BP54727 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAD23BP54727 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAD23BP54727 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAD23BP54727 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAD23BP54727 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAD23BP54727 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAD23BP54727 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAD23BP54727 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAD23BP54727 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAD23BP54727 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAD23BP54727 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAD23BP54727 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAD23BP54727 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAD23BP54727 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAD23BP54727 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAD23BP54727 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAD23BP54727 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAD23BP54727 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAD23BP54727 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAD23BP54727 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
RAD23BP54727 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAD23BP54727 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAD23BP54727 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAD23BP54727 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAD23BP54727 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAD23BP54727 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAD23BP54727 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAD23BP54727 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAD23BP54727 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAD23BP54727 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAD23BP54727 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAD23BP54727 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAD23BP54727 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAD23BP54727 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAD23BP54727 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAD23BP54727 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAD23BP54727 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAD23BP54727 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAD23BP54727 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAD23BP54727 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAD23BP54727 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAD23BP54727 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAD23BP54727 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAD23BP54727 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAD23BP54727 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
RAD23BP54727 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
RAD23BP54727 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAD23BP54727 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
RAD23BP54727 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAD23BP54727 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAD23BP54727 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAD23BP54727 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAD23BP54727 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAD23BP54727 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
RAD23BP54727 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAD23BP54727 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAD23BP54727 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAD23BP54727 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAD23BP54727 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAD23BP54727 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAD23BP54727 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAD23BP54727 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAD23BP54727 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAD23BP54727 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAD23BP54727 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
RAD23BP54727 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAD23BP54727 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAD23BP54727 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAD23BP54727 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAD23BP54727 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAD23BP54727 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAD23BP54727 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAD23BP54727 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAD23BP54727 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms