Protein–RNA interactions for Protein: P51587

BRCA2, Breast cancer type 2 susceptibility protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA2P51587 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BRCA2P51587 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BRCA2P51587 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BRCA2P51587 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BRCA2P51587 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BRCA2P51587 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
BRCA2P51587 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BRCA2P51587 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BRCA2P51587 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BRCA2P51587 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BRCA2P51587 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BRCA2P51587 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BRCA2P51587 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BRCA2P51587 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BRCA2P51587 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BRCA2P51587 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BRCA2P51587 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BRCA2P51587 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BRCA2P51587 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BRCA2P51587 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BRCA2P51587 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BRCA2P51587 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BRCA2P51587 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BRCA2P51587 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BRCA2P51587 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BRCA2P51587 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BRCA2P51587 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BRCA2P51587 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
BRCA2P51587 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BRCA2P51587 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BRCA2P51587 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BRCA2P51587 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BRCA2P51587 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BRCA2P51587 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BRCA2P51587 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BRCA2P51587 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BRCA2P51587 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BRCA2P51587 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BRCA2P51587 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
BRCA2P51587 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BRCA2P51587 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BRCA2P51587 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BRCA2P51587 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BRCA2P51587 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BRCA2P51587 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BRCA2P51587 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BRCA2P51587 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
BRCA2P51587 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BRCA2P51587 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BRCA2P51587 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
BRCA2P51587 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BRCA2P51587 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BRCA2P51587 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BRCA2P51587 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BRCA2P51587 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BRCA2P51587 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BRCA2P51587 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BRCA2P51587 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BRCA2P51587 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BRCA2P51587 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BRCA2P51587 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BRCA2P51587 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BRCA2P51587 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BRCA2P51587 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BRCA2P51587 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BRCA2P51587 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BRCA2P51587 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BRCA2P51587 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BRCA2P51587 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BRCA2P51587 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BRCA2P51587 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BRCA2P51587 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BRCA2P51587 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BRCA2P51587 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
BRCA2P51587 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BRCA2P51587 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BRCA2P51587 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BRCA2P51587 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BRCA2P51587 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BRCA2P51587 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BRCA2P51587 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BRCA2P51587 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
BRCA2P51587 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BRCA2P51587 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BRCA2P51587 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BRCA2P51587 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BRCA2P51587 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BRCA2P51587 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BRCA2P51587 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BRCA2P51587 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BRCA2P51587 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BRCA2P51587 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BRCA2P51587 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BRCA2P51587 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BRCA2P51587 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BRCA2P51587 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BRCA2P51587 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BRCA2P51587 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BRCA2P51587 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BRCA2P51587 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms