Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
SMARCA2P51531 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
SMARCA2P51531 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
SMARCA2P51531 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
SMARCA2P51531 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.15■■■■□ 3.06
SMARCA2P51531 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC34.15■■■■□ 3.06
SMARCA2P51531 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
SMARCA2P51531 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
SMARCA2P51531 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
SMARCA2P51531 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
SMARCA2P51531 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
SMARCA2P51531 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
SMARCA2P51531 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
SMARCA2P51531 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
SMARCA2P51531 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
SMARCA2P51531 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
SMARCA2P51531 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
SMARCA2P51531 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
SMARCA2P51531 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
SMARCA2P51531 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
SMARCA2P51531 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
SMARCA2P51531 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
SMARCA2P51531 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC34.15■■■■□ 3.06
SMARCA2P51531 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
SMARCA2P51531 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC34.15■■■■□ 3.06
SMARCA2P51531 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
SMARCA2P51531 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
SMARCA2P51531 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
SMARCA2P51531 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
SMARCA2P51531 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
SMARCA2P51531 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
SMARCA2P51531 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
SMARCA2P51531 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
SMARCA2P51531 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
SMARCA2P51531 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
SMARCA2P51531 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
SMARCA2P51531 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
SMARCA2P51531 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
SMARCA2P51531 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
SMARCA2P51531 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
SMARCA2P51531 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.13■■■■□ 3.05
SMARCA2P51531 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
SMARCA2P51531 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
SMARCA2P51531 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
SMARCA2P51531 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
SMARCA2P51531 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
SMARCA2P51531 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
SMARCA2P51531 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
SMARCA2P51531 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
SMARCA2P51531 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
SMARCA2P51531 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
SMARCA2P51531 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
SMARCA2P51531 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
SMARCA2P51531 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
SMARCA2P51531 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
SMARCA2P51531 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
SMARCA2P51531 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
SMARCA2P51531 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.13■■■■□ 3.05
SMARCA2P51531 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
SMARCA2P51531 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
SMARCA2P51531 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
SMARCA2P51531 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
SMARCA2P51531 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
SMARCA2P51531 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC34.12■■■■□ 3.05
SMARCA2P51531 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
SMARCA2P51531 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
SMARCA2P51531 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
SMARCA2P51531 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC34.12■■■■□ 3.05
SMARCA2P51531 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
SMARCA2P51531 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
SMARCA2P51531 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
SMARCA2P51531 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC34.12■■■■□ 3.05
SMARCA2P51531 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
SMARCA2P51531 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
SMARCA2P51531 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC34.11■■■■□ 3.05
SMARCA2P51531 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC34.11■■■■□ 3.05
SMARCA2P51531 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
SMARCA2P51531 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
SMARCA2P51531 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
SMARCA2P51531 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
SMARCA2P51531 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
SMARCA2P51531 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
SMARCA2P51531 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
SMARCA2P51531 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
SMARCA2P51531 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
SMARCA2P51531 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
SMARCA2P51531 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
SMARCA2P51531 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
SMARCA2P51531 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
SMARCA2P51531 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
SMARCA2P51531 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
SMARCA2P51531 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
SMARCA2P51531 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
SMARCA2P51531 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC34.1■■■■□ 3.05
SMARCA2P51531 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
SMARCA2P51531 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
SMARCA2P51531 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
SMARCA2P51531 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
SMARCA2P51531 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
SMARCA2P51531 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms