Protein–RNA interactions for Protein: P49642

PRIM1, DNA primase small subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRIM1P49642 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRIM1P49642 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRIM1P49642 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRIM1P49642 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRIM1P49642 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRIM1P49642 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRIM1P49642 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRIM1P49642 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRIM1P49642 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRIM1P49642 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRIM1P49642 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRIM1P49642 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRIM1P49642 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRIM1P49642 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRIM1P49642 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRIM1P49642 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PRIM1P49642 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRIM1P49642 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PRIM1P49642 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRIM1P49642 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRIM1P49642 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRIM1P49642 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PRIM1P49642 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRIM1P49642 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRIM1P49642 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRIM1P49642 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRIM1P49642 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRIM1P49642 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRIM1P49642 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PRIM1P49642 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRIM1P49642 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PRIM1P49642 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRIM1P49642 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRIM1P49642 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRIM1P49642 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRIM1P49642 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRIM1P49642 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRIM1P49642 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRIM1P49642 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRIM1P49642 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRIM1P49642 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRIM1P49642 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRIM1P49642 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRIM1P49642 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRIM1P49642 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRIM1P49642 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRIM1P49642 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRIM1P49642 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRIM1P49642 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRIM1P49642 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRIM1P49642 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRIM1P49642 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PRIM1P49642 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PRIM1P49642 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PRIM1P49642 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PRIM1P49642 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRIM1P49642 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRIM1P49642 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRIM1P49642 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRIM1P49642 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRIM1P49642 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRIM1P49642 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRIM1P49642 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRIM1P49642 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRIM1P49642 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRIM1P49642 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRIM1P49642 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRIM1P49642 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRIM1P49642 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRIM1P49642 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PRIM1P49642 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRIM1P49642 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRIM1P49642 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRIM1P49642 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRIM1P49642 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRIM1P49642 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRIM1P49642 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRIM1P49642 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRIM1P49642 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRIM1P49642 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRIM1P49642 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRIM1P49642 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRIM1P49642 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRIM1P49642 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PRIM1P49642 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRIM1P49642 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRIM1P49642 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRIM1P49642 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRIM1P49642 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRIM1P49642 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRIM1P49642 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRIM1P49642 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRIM1P49642 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRIM1P49642 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRIM1P49642 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRIM1P49642 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PRIM1P49642 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRIM1P49642 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PRIM1P49642 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PRIM1P49642 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms