Protein–RNA interactions for Protein: P48788

TNNI2, Troponin I, fast skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI2P48788 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNNI2P48788 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNNI2P48788 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNNI2P48788 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNNI2P48788 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNNI2P48788 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNNI2P48788 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TNNI2P48788 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNNI2P48788 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNNI2P48788 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNNI2P48788 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNNI2P48788 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNNI2P48788 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNNI2P48788 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNNI2P48788 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNNI2P48788 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNNI2P48788 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNNI2P48788 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNNI2P48788 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNNI2P48788 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNNI2P48788 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNNI2P48788 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNNI2P48788 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNNI2P48788 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNNI2P48788 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNNI2P48788 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNNI2P48788 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNNI2P48788 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TNNI2P48788 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNNI2P48788 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TNNI2P48788 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNNI2P48788 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNNI2P48788 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNNI2P48788 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNNI2P48788 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNNI2P48788 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNNI2P48788 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TNNI2P48788 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNNI2P48788 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNNI2P48788 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNNI2P48788 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNNI2P48788 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNNI2P48788 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNNI2P48788 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNNI2P48788 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNNI2P48788 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNNI2P48788 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNNI2P48788 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNNI2P48788 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNNI2P48788 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNNI2P48788 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNNI2P48788 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNNI2P48788 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNNI2P48788 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNNI2P48788 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNNI2P48788 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNNI2P48788 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TNNI2P48788 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNNI2P48788 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNNI2P48788 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNNI2P48788 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNNI2P48788 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNNI2P48788 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNNI2P48788 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNNI2P48788 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNNI2P48788 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNNI2P48788 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNNI2P48788 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNNI2P48788 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNNI2P48788 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNNI2P48788 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNNI2P48788 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNNI2P48788 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNNI2P48788 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TNNI2P48788 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNNI2P48788 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNNI2P48788 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNNI2P48788 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNNI2P48788 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNNI2P48788 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNNI2P48788 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNNI2P48788 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNNI2P48788 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNNI2P48788 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TNNI2P48788 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TNNI2P48788 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TNNI2P48788 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNNI2P48788 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNNI2P48788 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNNI2P48788 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNNI2P48788 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNNI2P48788 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNNI2P48788 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TNNI2P48788 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNNI2P48788 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNNI2P48788 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNNI2P48788 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNNI2P48788 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNNI2P48788 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNNI2P48788 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms