Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATRXP46100 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATRXP46100 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATRXP46100 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATRXP46100 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATRXP46100 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATRXP46100 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATRXP46100 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATRXP46100 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATRXP46100 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATRXP46100 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
ATRXP46100 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
ATRXP46100 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
ATRXP46100 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
ATRXP46100 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATRXP46100 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATRXP46100 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATRXP46100 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATRXP46100 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATRXP46100 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATRXP46100 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATRXP46100 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATRXP46100 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATRXP46100 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATRXP46100 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
ATRXP46100 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATRXP46100 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATRXP46100 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATRXP46100 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATRXP46100 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATRXP46100 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATRXP46100 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATRXP46100 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATRXP46100 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATRXP46100 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATRXP46100 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATRXP46100 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATRXP46100 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATRXP46100 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATRXP46100 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATRXP46100 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
ATRXP46100 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATRXP46100 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATRXP46100 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATRXP46100 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATRXP46100 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATRXP46100 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATRXP46100 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATRXP46100 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATRXP46100 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATRXP46100 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATRXP46100 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATRXP46100 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ATRXP46100 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATRXP46100 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ATRXP46100 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ATRXP46100 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ATRXP46100 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ATRXP46100 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ATRXP46100 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ATRXP46100 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ATRXP46100 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ATRXP46100 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
ATRXP46100 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ATRXP46100 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ATRXP46100 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATRXP46100 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATRXP46100 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATRXP46100 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATRXP46100 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATRXP46100 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATRXP46100 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATRXP46100 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATRXP46100 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ATRXP46100 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATRXP46100 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATRXP46100 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATRXP46100 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ATRXP46100 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATRXP46100 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATRXP46100 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATRXP46100 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATRXP46100 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATRXP46100 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATRXP46100 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATRXP46100 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATRXP46100 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATRXP46100 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATRXP46100 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATRXP46100 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATRXP46100 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATRXP46100 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATRXP46100 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATRXP46100 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATRXP46100 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATRXP46100 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATRXP46100 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATRXP46100 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATRXP46100 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATRXP46100 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms