Protein–RNA interactions for Protein: P43694

GATA4, Transcription factor GATA-4, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA4P43694 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATA4P43694 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATA4P43694 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATA4P43694 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATA4P43694 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATA4P43694 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATA4P43694 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATA4P43694 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATA4P43694 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATA4P43694 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATA4P43694 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATA4P43694 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATA4P43694 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATA4P43694 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATA4P43694 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATA4P43694 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATA4P43694 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATA4P43694 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATA4P43694 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GATA4P43694 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATA4P43694 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATA4P43694 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATA4P43694 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATA4P43694 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATA4P43694 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATA4P43694 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATA4P43694 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GATA4P43694 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATA4P43694 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATA4P43694 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATA4P43694 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATA4P43694 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATA4P43694 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATA4P43694 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATA4P43694 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATA4P43694 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATA4P43694 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATA4P43694 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATA4P43694 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATA4P43694 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATA4P43694 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GATA4P43694 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GATA4P43694 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GATA4P43694 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GATA4P43694 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GATA4P43694 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GATA4P43694 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GATA4P43694 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GATA4P43694 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GATA4P43694 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GATA4P43694 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GATA4P43694 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GATA4P43694 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GATA4P43694 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GATA4P43694 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GATA4P43694 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GATA4P43694 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GATA4P43694 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GATA4P43694 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GATA4P43694 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GATA4P43694 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GATA4P43694 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GATA4P43694 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GATA4P43694 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GATA4P43694 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GATA4P43694 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GATA4P43694 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GATA4P43694 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GATA4P43694 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GATA4P43694 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GATA4P43694 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GATA4P43694 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GATA4P43694 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GATA4P43694 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GATA4P43694 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GATA4P43694 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GATA4P43694 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GATA4P43694 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GATA4P43694 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GATA4P43694 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GATA4P43694 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GATA4P43694 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GATA4P43694 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GATA4P43694 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GATA4P43694 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GATA4P43694 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GATA4P43694 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GATA4P43694 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GATA4P43694 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GATA4P43694 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GATA4P43694 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GATA4P43694 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GATA4P43694 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GATA4P43694 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GATA4P43694 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GATA4P43694 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GATA4P43694 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GATA4P43694 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GATA4P43694 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GATA4P43694 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms