Protein–RNA interactions for Protein: P41229

KDM5C, Lysine-specific demethylase 5C, humanhuman

Predictions only

Length 1,560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5CP41229 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
KDM5CP41229 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
KDM5CP41229 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
KDM5CP41229 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
KDM5CP41229 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
KDM5CP41229 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
KDM5CP41229 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
KDM5CP41229 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
KDM5CP41229 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
KDM5CP41229 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
KDM5CP41229 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
KDM5CP41229 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
KDM5CP41229 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
KDM5CP41229 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
KDM5CP41229 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
KDM5CP41229 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
KDM5CP41229 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
KDM5CP41229 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
KDM5CP41229 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
KDM5CP41229 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
KDM5CP41229 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
KDM5CP41229 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
KDM5CP41229 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC28.78■■■□□ 2.2
KDM5CP41229 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
KDM5CP41229 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
KDM5CP41229 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
KDM5CP41229 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
KDM5CP41229 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
KDM5CP41229 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
KDM5CP41229 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
KDM5CP41229 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
KDM5CP41229 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
KDM5CP41229 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
KDM5CP41229 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
KDM5CP41229 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
KDM5CP41229 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
KDM5CP41229 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
KDM5CP41229 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
KDM5CP41229 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
KDM5CP41229 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
KDM5CP41229 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
KDM5CP41229 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
KDM5CP41229 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
KDM5CP41229 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
KDM5CP41229 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
KDM5CP41229 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
KDM5CP41229 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
KDM5CP41229 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
KDM5CP41229 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
KDM5CP41229 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
KDM5CP41229 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
KDM5CP41229 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
KDM5CP41229 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
KDM5CP41229 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
KDM5CP41229 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
KDM5CP41229 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
KDM5CP41229 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
KDM5CP41229 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
KDM5CP41229 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
KDM5CP41229 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
KDM5CP41229 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
KDM5CP41229 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
KDM5CP41229 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
KDM5CP41229 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
KDM5CP41229 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
KDM5CP41229 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
KDM5CP41229 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
KDM5CP41229 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
KDM5CP41229 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
KDM5CP41229 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
KDM5CP41229 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
KDM5CP41229 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
KDM5CP41229 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
KDM5CP41229 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
KDM5CP41229 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
KDM5CP41229 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
KDM5CP41229 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
KDM5CP41229 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
KDM5CP41229 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
KDM5CP41229 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
KDM5CP41229 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
KDM5CP41229 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
KDM5CP41229 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
KDM5CP41229 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
KDM5CP41229 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
KDM5CP41229 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
KDM5CP41229 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
KDM5CP41229 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
KDM5CP41229 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
KDM5CP41229 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
KDM5CP41229 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
KDM5CP41229 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
KDM5CP41229 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
KDM5CP41229 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
KDM5CP41229 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC28.72■■■□□ 2.19
KDM5CP41229 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
KDM5CP41229 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
KDM5CP41229 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
KDM5CP41229 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
KDM5CP41229 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms