Protein–RNA interactions for Protein: P41222

PTGDS, Prostaglandin-H2 D-isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDSP41222 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PTGDSP41222 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTGDSP41222 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTGDSP41222 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTGDSP41222 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTGDSP41222 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTGDSP41222 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTGDSP41222 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTGDSP41222 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTGDSP41222 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTGDSP41222 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTGDSP41222 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTGDSP41222 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTGDSP41222 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTGDSP41222 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTGDSP41222 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTGDSP41222 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PTGDSP41222 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTGDSP41222 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTGDSP41222 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PTGDSP41222 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTGDSP41222 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTGDSP41222 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTGDSP41222 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTGDSP41222 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTGDSP41222 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTGDSP41222 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PTGDSP41222 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTGDSP41222 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTGDSP41222 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTGDSP41222 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTGDSP41222 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTGDSP41222 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTGDSP41222 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTGDSP41222 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTGDSP41222 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTGDSP41222 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTGDSP41222 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTGDSP41222 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTGDSP41222 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTGDSP41222 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTGDSP41222 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTGDSP41222 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTGDSP41222 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTGDSP41222 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTGDSP41222 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTGDSP41222 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTGDSP41222 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTGDSP41222 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTGDSP41222 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTGDSP41222 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTGDSP41222 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTGDSP41222 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTGDSP41222 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PTGDSP41222 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTGDSP41222 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTGDSP41222 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTGDSP41222 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTGDSP41222 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTGDSP41222 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTGDSP41222 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTGDSP41222 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTGDSP41222 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTGDSP41222 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTGDSP41222 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTGDSP41222 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTGDSP41222 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTGDSP41222 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTGDSP41222 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTGDSP41222 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTGDSP41222 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTGDSP41222 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTGDSP41222 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTGDSP41222 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTGDSP41222 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PTGDSP41222 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTGDSP41222 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTGDSP41222 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PTGDSP41222 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTGDSP41222 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTGDSP41222 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTGDSP41222 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTGDSP41222 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTGDSP41222 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTGDSP41222 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTGDSP41222 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTGDSP41222 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTGDSP41222 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTGDSP41222 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTGDSP41222 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTGDSP41222 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTGDSP41222 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTGDSP41222 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTGDSP41222 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTGDSP41222 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTGDSP41222 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTGDSP41222 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTGDSP41222 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTGDSP41222 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTGDSP41222 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.4 ms